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16S預測宏基因組最強R包-Tax4Fun
時間 2020-01-17
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以前在公衆號的文章《根據16S預測微生物羣落功能最全攻略》閱讀人數近3000人,有需求的用戶仍是很是多的。其中提到了4個軟件,以前已經介紹了其中很是有特色的三種,分別爲: - PICRUSt預測宏基因組: 優勢是高引流行,但缺點是數據太舊,GreenGene數據庫13年5月後再無更新。 - FAPROTAX預測元素循環:主要基於物種名預測元素循環相關功能。 - bugbase預測細菌表型:主要預測
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