Amber中對體系的距離角度和二面角加以限制

產生NMR的限制： 在使用加限制的PDB文件時，文件中的結構必須包含H原子，如果不包含可以使用命令： ambpdb -aatm -p prmtop < inprcd > amb.pdb 做此步的目的是保留正確的原子序號. 1.距離的限制 爲了獲得Amber中sander程序的距離限制的輸入文件，我們需要準備一個7列的限制輸入文件.對於文件中的每一行表示一個限制. 1st_res# 1st_res_

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