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分析方法升級&三代測序輔助,優化無參轉錄組測序策略
時間 2020-12-31
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第三代測序 技術
基因組組裝assembly
生物信息學
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分析方法升級&三代測序輔助,優化無參轉錄組測序策略 無參轉錄組拼接升級 Corset 讓「基因」概念更準確 在無參轉錄組項目中,利用主流軟件 Trinity 進行 De novo 拼接轉錄本, 而後選取最長的轉錄本作爲 unigene 進行後續分析。 但是研究表明,完全以 unigene 作爲基因的替身,有失恰當。 因爲,拼接出來的最長轉錄本會掩蓋掉本應真實的較短轉錄本(基因的 isoform)所
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