Nanopore測序的基因組組裝策略

最近拿到了nanopore的數據，嘗試對其組裝。目前用的是Canu，預計2個月內才能走完第一波分析，速度實在感人，所以翻了翻文獻，找找組裝方法。 目前Nanopore賣點主要是兩個角度：第一是Nanopore的讀長長，某些情況下能夠達到單條上M，但是這種情況可遇而不可求，很多時候只存在於宣傳冊上。另一個則是Nanpore便宜，這樣就能夠保證測序深度，從而提高組裝質量。 但是Nanopore也有一個

>>阅读原文<<