如何在cluster上跑R腳本

R 是一個比較不錯可是有時候操蛋的語言，不錯是由於用着爽的時候真的很爽，操蛋是由於這種爽不是何時均可以的，好比說在cluster上批處理跑R腳本。

固然說這話有些在上面跑過的各類不服氣，你丫傻逼吧這麼簡單都不會，呵呵，別急，我今天就是來看看怎麼在cluster上提交R腳本的。

 

R有幾種命令行處理模式，典型的是

R COMMAND BATCH "--args arg1 arg2.." *.r *.out

R --vanilla --args arg1 arg2 ... <*.r >*.out

Rscript *.r arg1 arg2 ...

 

固然，在結點上用第一個很操蛋，由於你的bash腳本不太好處理「" 內的問題，第二個比較容易，估計不少人用的是這個，今天講講第三個怎麼用：

首先，咱們這裏假設有個R腳本叫hi.r

在第一行加上

#！/usr/bin/Rscript

熟悉腳本語言的都知道，這是告訴解釋器你丫在這裏面找可執行文件

接着

chmod +x *.r

把該腳本變成一個可執行文件

而後用這個命令提交

qsub -b y *.r arg1 arg2...

有人問-b是啥，這個是必須的，告訴qsub 你丫要執行一個可執行的文件，因此y 是yes的意思

好了到此爲止～