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UDSMProt:蛋白質分類通用深度序列模型
時間 2021-01-13
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作者 | 李梓盟 審稿 | 董靖鑫 今天給大家介紹由德國弗勞恩霍夫·海因裏希·赫茲研究所的研究人員發表在Bioinformatics上的一篇文章。該文章針對大多數蛋白質分類的最先進方法都是爲單個分類任務量身定製,並且依賴手工製作特徵的問題,提出了通用的深度序列模型UDSMProt。該模型在來自Swiss-Prot的未標記蛋白質序列上進行了預訓練,並在蛋白質分類任務上進行微調,然後應用於三個典型任務
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