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使用Canu對三代測序進行基因組組裝
時間 2020-12-31
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Canu簡介 Canu是Celera的繼任者,能用於組裝PacBio和Nanopore兩家公司得到的測序結果。 Canu分爲三個步驟,糾錯,修整和組裝,每一步都差不多是如下幾個步驟: 加載read到read數據庫,gkpStore 對k-mer進行技術,用於計算序列間的overlap 計算overlap 加載overlap到overlap數據庫,OvlStore 根據read和overlap完成特
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