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bam文件softclip , hardclip ,markduplicate的探究
時間 2021-01-17
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測序產生的bam文件,有一些reads在cigar值裏顯示存在softclip,有一些存在hardclip,究竟softclip和hardclip是怎麼判斷出來的,還有是怎麼標記duplicate的reads的,我懷着這些問題進行了探究。 測試步驟 編輯兩個bed文件,分別含有我們需要的read1和read2位置,這裏每個文件包含兩條read1或者兩條read2,read1、read2一對作爲
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