Python數據可視化——使用Matplotlib建立散點圖

 Python數據可視化——使用Matplotlib建立散點圖html

2017-12-27算法

做者:淡水化合物後端

Matplotlib簡述:
  Matplotlib是一個用於建立出高質量圖表的桌面繪圖包(主要是2D方面)。該項目是由John Hunter於2002年啓動的,其目的是爲Python構建一個MATLAB式的繪圖接口。若是結合Python IDE使用好比PyCharm,matplotlib還具備諸如縮放和平移等交互功能。它不只支持各類操做系統上許多不一樣的GUI後端,並且還能將圖片導出爲各類常見的矢量(vector)和光柵(raster)圖:PDF、SVG、JPG、PNG、BMP、GIF等。 此外,Matplotlib還有許多插件工具集,如用於3D圖形的mplot3d以及用於地圖和投影的basemap。
準備數據:從文本文件中解析數據(數據來源於《機器學習實戰》第二章 k鄰近算法)
datingTestSet2.txt文件下載地址: https://pan.baidu.com/s/1v2aINNptUHGgvMps2a_9Zg 提取碼yuef 

 

  本文使用的數據主要包含如下三種特徵:每一年得到的飛行常客里程數,玩視頻遊戲所耗時間百分比,每週消費的冰淇淋公升數。其中分類結果做爲文件的第四列,而且只有三、二、1三種分類值。datingTestSet2.csv文件格式以下所示:
 
飛行里程數 遊戲耗時百分比 冰淇淋公升數 分類結果
40920 8.326976 0.953952 3
14488 7.153469 1.673904 2
26052 1.441871 0.805124 1
...... ...... ...... ......

  數據在datingTestSet2.txt文件中的格式以下所示:app

   上述特徵數據的格式通過file2matrix函數解析處理以後,可輸出爲矩陣和類標籤向量。將文本記錄轉換爲Numpy的解析程序,將如下代碼保存在kNN.py中:
from numpy import *
def file2matrix(filename): fr = open(filename) numberOfLines = len(fr.readlines()) # get the number of lines in the file
    returnMat = zeros((numberOfLines, 3)) # prepare matrix to return
    classLabelVector = []  # prepare labels return
    fr = open(filename) index = 0 for line in fr.readlines(): line = line.strip() listFromLine = line.split('\t') returnMat[index, :] = listFromLine[0:3] classLabelVector.append(int(listFromLine[-1])) index += 1
    return returnMat, classLabelVector

  

  使用file2matrix讀取文件數據,必須確保待解析文件存儲在當前的工做目錄中。導入數據以後,簡單檢查一下數據格式:機器學習

 

>>>import kNN >>>datingDataMat,datingLabels = kNN.file2matrix('datingTestSet2.txt') >>>datingDataMat[0:6] array([[ 4.09200000e+04,   8.32697600e+00,   9.53952000e-01], [ 1.44880000e+04,   7.15346900e+00,   1.67390400e+00], [ 2.60520000e+04,   1.44187100e+00,   8.05124000e-01], [ 7.51360000e+04,   1.31473940e+01,   4.28964000e-01], [ 3.83440000e+04,   1.66978800e+00,   1.34296000e-01], [ 7.29930000e+04,   1.01417400e+01,   1.03295500e+00]]) >>> datingLabels[0:6] [3, 2, 1, 1, 1, 1]

 分析數據:使用Matplotlib建立散點圖函數

  編輯kNN.py文件,引入matplotlib,調用matplotlib的scatter繪製散點圖。
>>> import matplotlib >>> import matplotlib.pyplot as plt >>> fig = plt.figure() >>> ax = fig.add_subplot(111) >>> ax.scatter(datingDataMat[:,1],datingDataMat[:,2]) <matplotlib.collections.PathCollection object at 0x0000019E14C9A470>
>>> plt.show() >>>

  生成的散點圖以下:工具

  散點圖使用datingDataMat矩陣的第2、第三列數據,分別表示特徵值「玩視頻遊戲所耗時間百分比」和「每週消費的冰淇淋公升數」。kNN.py完整代碼以下:
import matplotlib import numpy as np from numpy import *
from matplotlib import pyplot as plt def file2matrix(filename): fr = open(filename) numberOfLines = len(fr.readlines())  # get the number of lines in the file
    returnMat = zeros((numberOfLines, 3))  # prepare matrix to return
    classLabelVector = []  # prepare labels return
    fr = open(filename) index = 0 for line in fr.readlines(): line = line.strip() listFromLine = line.split('\t') returnMat[index, :] = listFromLine[0:3] classLabelVector.append(int(listFromLine[-1])) index += 1
    return returnMat, classLabelVector datingDataMat,datingLabels = file2matrix('datingTestSet2.txt') fig = plt.figure() ax = plt.subplot(111) ax.scatter(datingDataMat[:,1],datingDataMat[:,2]) plt.show()

 

  上圖因爲沒有使用樣本分類的特徵值,很難看到任何有用的數據模式信息。爲了更好理解數據信息,Matplotlib庫提供的scatter函數支持個性化標記散點圖上的點。調用scatter函數使用下列參數:學習

 

ax.scatter(datingDataMat[:,1],datingDataMat[:,2],15.0*array(datingLabels),15.0*array(datingLabels))

  生成的散點圖以下:字體

  上圖利用datingLabels存儲的類標籤屬性,在散點圖上繪製了色彩不等、尺寸不一樣的點。於是基本上能夠從圖中看到數據點所屬三個樣本分類的區域輪廓。爲了獲得更好的效果,採用datingDataMat矩陣的屬性列1和2展現數據,並以紅色的'*'表示類標籤一、藍色的'o'表示表示類標籤二、綠色的'+'表示類標籤3,修改參數以下:
import matplotlib import numpy as np from numpy import *
from matplotlib import pyplot as plt from matplotlib.font_manager import FontProperties def file2matrix(filename): fr = open(filename) numberOfLines = len(fr.readlines())  # get the number of lines in the file
    returnMat = zeros((numberOfLines, 3))  # prepare matrix to return
    classLabelVector = []  # prepare labels return
    fr = open(filename) index = 0 for line in fr.readlines(): line = line.strip() listFromLine = line.split('\t') returnMat[index, :] = listFromLine[0:3] classLabelVector.append(int(listFromLine[-1])) index += 1
    return returnMat, classLabelVector zhfont = FontProperties(fname='C:/Windows/Fonts/simsun.ttc',size=12) datingDataMat,datingLabels = file2matrix('datingTestSet2.txt') fig = plt.figure() plt.figure(figsize=(8, 5), dpi=80) ax = plt.subplot(111) datingLabels = np.array(datingLabels) idx_1 = np.where(datingLabels==1) p1 = ax.scatter(datingDataMat[idx_1,0],datingDataMat[idx_1,1],marker = '*',color = 'r',label='1',s=10) idx_2 = np.where(datingLabels==2) p2 = ax.scatter(datingDataMat[idx_2,0],datingDataMat[idx_2,1],marker = 'o',color ='g',label='2',s=20) idx_3 = np.where(datingLabels==3) p3 = ax.scatter(datingDataMat[idx_3,0],datingDataMat[idx_3,1],marker = '+',color ='b',label='3',s=30) plt.xlabel(u'每一年獲取的飛行里程數', fontproperties=zhfont) plt.ylabel(u'玩視頻遊戲所消耗的事件百分比', fontproperties=zhfont) ax.legend((p1, p2, p3), (u'不喜歡', u'魅力通常', u'極具魅力'), loc=2, prop=zhfont) plt.show()

 

  生成的散點圖以下:spa

第二種方法:

 

import matplotlib from matplotlib import pyplot as plt from matplotlib import font_manager def file2matrix(filename): fr = open(filename) numberOfLines = len(fr.readlines())  # get the number of lines in the file
    returnMat = zeros((numberOfLines, 3))  # prepare matrix to return
    classLabelVector = []  # prepare labels return
    fr = open(filename) index = 0 for line in fr.readlines(): line = line.strip() listFromLine = line.split('\t') returnMat[index, :] = listFromLine[0:3] classLabelVector.append(int(listFromLine[-1])) index += 1
    return returnMat, classLabelVector matrix, labels = file2matrix('datingTestSet2.txt') zhfont = matplotlib.font_manager.FontProperties(fname='C:/Windows/Fonts/simsun.ttc',size=12) plt.figure(figsize=(8, 5), dpi=80) axes = plt.subplot(111) # 將三類數據分別取出來 # x軸表明飛行的里程數 # y軸表明玩視頻遊戲的百分比
type1_x = [] type1_y = [] type2_x = [] type2_y = [] type3_x = [] type3_y = [] for i in range(len(labels)): if labels[i] == 1:  # 不喜歡
 type1_x.append(matrix[i][0]) type1_y.append(matrix[i][1]) if labels[i] == 2:  # 魅力通常
 type2_x.append(matrix[i][0]) type2_y.append(matrix[i][1]) if labels[i] == 3:  # 極具魅力
        #print (i, ':', labels[i], ':', type(labels[i]))
 type3_x.append(matrix[i][0]) type3_y.append(matrix[i][1]) type1 = axes.scatter(type1_x, type1_y, s=20, c='red') type2 = axes.scatter(type2_x, type2_y, s=40, c='green') type3 = axes.scatter(type3_x, type3_y, s=50, c='blue') plt.xlabel(u'每一年獲取的飛行里程數', fontproperties=zhfont) plt.ylabel(u'玩視頻遊戲所消耗的事件百分比', fontproperties=zhfont) axes.legend((type1, type2, type3), (u'不喜歡', u'魅力通常', u'極具魅力'), loc=2, prop=zhfont) plt.show()

 生成的散點圖以下:

 

總結:
本文簡單介紹了Matplotlib,並以實例分析瞭如何使用Matplotlib庫圖形化展現數據,最後經過修改matplotlib的scatter函數參數使得散點圖的分類區域更加清晰。
附加知識點:
一、在使用Matplotlib生成圖表時,默認不支持漢字,全部漢字都會顯示成框框
解決方法:代碼中指定中文字體
# -*- coding: utf-8 -*-
import matplotlib.pyplot as plt import matplotlib zhfont1 = matplotlib.font_manager.FontProperties(fname='C:/Windows/Fonts/simsun.ttc') plt.xlabel(u"橫座標xlabel",fontproperties=zhfont1)

  到C:\Windows\Fonts\中找到新宋體對應的字體文件simsun.ttf(Window 8和Windows10系統是simsun.ttc,也能夠使用其餘字體)

二、ax = fig.add_subplot(111)
  返回Axes實例
  參數一, 子圖總行數
  參數二, 子圖總列數
  參數三, 子圖位置
  在Figure上添加Axes的經常使用方法
創做不易, 以爲不錯就鼓勵一下吧!Creation is not easy to feel good, just encourage it.
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