3D Slicer中文教程（六）—調用matlab函數（MatlabBridge使用方法）

1.安裝MatlabBridge插件

（1）在工具欄找到Extension，點擊進入Extension Manager

（2）找到MatlabBridge,安裝

2.配置MATLAB環境

（1）在模塊處找到Developer Tools——Matlab——Matlab Modules Generator

 

（2）在Matlab executable處配置matlab.exe的路徑（請確保計算機上安裝有matlab，而且能夠找到matlab.exe文件的位置）；Matlab script directory的路徑爲存儲.m文件的位置。

3.利用MATLAB函數（function）分割圖像

（1）建立matlab module,在Module name處命名文件

（2）點擊Generate module

（3）Matlab module包含三個文件：

•Matlabscript (*.m)：Slicer調用的Matlab函數，該文件必須由用戶定製，以執行全部必要的數據輸入，處理和輸出。

•Module descriptor(*.xml)：模塊描述符，該XML文件定義將在3D切片機中爲模塊顯示的圖形用戶界面，該文件必須針對特定的Matlab函數進行自定義。

•Module proxy（* .bat）：模塊代理，該文件生成一次，不須要更改。

.m文件

.xml文件

（4）退出3D Slicer，從新打開

（5）打開樣本數據，這裏打開下載的MRHead數據

（6）在Module工具欄找到新建的matlab module，點擊文件

 

（7）設置Input Volume爲MRHead, Output Volume爲Create new Volume

 

（8）點擊apply按鈕查看結果，以下圖所示的結果

 

 

    總結：3D Slicer調用matlab函數的方法使得圖像處理能夠更容易編程處理，方便像素級的處理。可是，也存在必定的難度。首先，安裝MatlabBridge而且學會使用；其次，是須要明白其中參數的意義，才能更好的編寫matlab函數處理圖像；最後，須要明白在3D Slicer自帶的功能下處理圖像和matlab編程處理圖像之間如何選擇更簡單有效的方式，也是十分重要的事情。