簡單易用的序列處理工具SeqHandler介紹

簡單易用的序列處理工具SeqHandler-v1.0.0介紹

下載地址python

在實際工做工程中常常須要處理一些序列,須要的功能可能也是極其簡單的,好比:查看長度、ATCG各個鹼基的含量、GC含量等等。個人作法是把那個須要拷貝到ipython(一個Python的解釋工具),而後再各類操做,操做到了發現這些東西都是重複性的,並且是很簡單的,因而就萌生了作一個簡單的序列處理工具的想法。工具

如今SeqHandler的功能有限,僅有:長度、ATCG含量統計、GC含量統計、反向互補、截取子序列功能,你們對功能提一些建議。spa

使用的方法也是很簡單地:圖片

  1. 第一步,打開序列文件(目前支持fa、fq、gb),支持一個文件裏面含有多條序列
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  2. 選中序列
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  3. 各類操做
    ![圖片描述][3]
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