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宏基因組拼接方法
時間 2021-01-06
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de novo定義:from the beginning(從頭拼接), no reference genome guided(無參考基因組) 三類de novo基因拼接的計算方法: 1. Greedy algorithm:對於含重複區的序列拼接效果不好 Shortest common string (SCS):最短的、包含原序列S中所有的k-mer的序列 但是Greedy algorithm爲追求
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