Gromacs/模擬基本流程

Gromacs/模擬基本流程 可以使用以下步驟進行Gromacs的初步模擬： 產生模擬必須的 .gro文件 .itp文件 和 .top文件(比如從蛋白數據庫下了一個pro.pdb蛋白質結構文件） 輸入爲：pro.pdb 輸出爲：pro.gro topol.top posre.itp 命令爲：pdb2gmx -f pro.pdb -water tip4p (-o pro.gro) -ter -ign

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