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如何從NCBI下載SRA數據
時間 2020-12-26
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經常需要在GEO中下載測序數據原始文件,得到sra編號之後,有兩種方法下載: 一、可以通過在ebi(http://www.ebi.ac.uk/)中搜索SRA編號,然後用aspera直接下載fastq文件,詳情參考本博客《Chip-seq流程報告》 二、然而有的數據在ebi上並沒有提供fastq文件,這個時候就只能下載SRA文件,然後用sratoolkit中的fastq-dump進行轉換 後文將詳細
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