Coding and Paper Letter(六十五)

因爲忙於碩士畢業相關事宜,很是久沒有更新博客,如今回來更新博客,第一篇仍是資源整理類。html

1 Coding:

1.USGS EROS數據分發系統的API接口,非官方API。node

espa apipython

2.R語言包Taipan,Taipan是一種在準備分析時註釋圖像的工具。git

taipangithub

3.R語言包sugarbag,建立用於可視化地理空間數據的鑲嵌六邊形地圖。 定位相同尺寸的六邊形以最好地保持各個區域和最近焦點之間的關係,並最小化與其實際位置的距離。 該方法容許以相同的視覺比例對全部區域進行比較,並提供了對製圖的替代方案。算法

sugarbagdocker

4.R的docker鏡像。編程

r docker後端

5.適用於Python的高級應用和儀表板解決方案,Panel提供了一些工具,能夠輕鬆地將小部​​件,繪圖,表格和其餘可查看的對象和控件組合到控制面板,應用程序和儀表板中。 Panel使用來自Bokeh,Matplotlib,HoloViews和其餘Python繪圖庫的可視化,使它們能夠單獨查看,也能夠與控制它們的交互式小部件結合使用。 Panel在Jupyter筆記本中一樣運行良好,用於建立快速數據探索工具,或做爲獨立部署的應用程序和儀表板,並容許您根據須要輕鬆切換這些上下文。api

panel

6.無人機攝影測量和卷積神經網絡加強自動化和準確的鯨類物種識別,發表於Methods in Ecology and Evolution的論文代碼、docker鏡像與數據。

cetacean photogram

7.R語言包encryptedRmd,目標是提供密碼保護markdown html文檔的功能,並安全地與他人共享。 解密文件所需的代碼被捆綁到導出的html文件中,這使得生成的文件徹底自包含。

encryptedRmd

8.本教程介紹了ncar數據處理工具Cheyenne/DAV Python環境的安裝和設置。

ncar pangeo tutorial

9.R語言包validate,能夠很是輕鬆地檢查數據是否符合您對領域知識的指望。 它的工做原理是容許您定義獨立於代碼或數據集的數據驗證規則。 接下來,您可使用規則來對抗數據集或其各類版本。 結果能夠彙總,繪圖等。

validate

10.數據工程師祕籍。

Cookbook

11.Voronoi/Delaunay圖像處理,該項目實現了一個小型,輕量級的工具,用於使用Voronoi / Delaunay數據結構進行實時圖像處理。

Voronoi Image Manipulation

12.GeoNode是一個開源平臺,能夠促進地理空間數據的建立,共享和協做使用。

geonode

13.一個功能齊全的pythonic庫,用於表示和使用四元數組。

pyquaternion

14.dataretrieval是USGS-R的dataRetrieval包的Python替代方案,用於直接從Web服務獲取USGS或EPA水質數據,流數據和元數據。 請注意,dataretrieval是R包的替代品,而不是端口,由於它重現了R包的功能,但其組織和功能一般不一樣。 Python版本還擴展了其前身,包括從NWIS和STORET之外的各類Web門戶中提取數據的功能。若是有一個您但願與之合做的水文或環境數據門戶,請將其做爲一個問題提出。如下是如何使用dataretrievel從國家水信息系統(NWIS)反演數據的示例。

dataretrieval

15.用於分析USEPA GitHub組織存儲庫的使用的代碼。

epa github org analysis

16.免費編程書籍。

free programming books

17.機器學習,統計和人工智能研究相關的幻燈片,紙質筆記,課堂筆記,博客文章。

csinva.github.io

18.緬因灣魚類生物量的生態預測。

maine fish

19.plotly的R書籍。

plotly book

20.使用Kaggle內核當即運行任何Jupyter筆記本。

kernel run

21.火星座標(GCJ-02, BD-09, WGS)轉換工具,支持命令行和Python API,支持點、線、面,支持GeoJson、shapefile...

coord convert

22.R語言包dplyr,數據處理清洗神器。

dplyr

23.edaviz - 用於Jupyter Notebook或Jupyter Lab中的探索性數據分析和可視化的Python庫,edaviz是一個用於Jupyter Notebook和Jupyter Lab中的數據探索和可視化的python庫。 edaviz爲您提供開箱即用的默承認視化。

edaviz

24.交互式Jupyter小部件能夠在2D和3D中可視化圖像,點集和網格。

itkwidgets

25.R語言包rasterFunctions,R語言包raster的自定義處理函數。它們擴展了R包柵格中的函數。

rasterFunctions

26.在LaTeX中繪製貝葉斯網絡,圖形模型和技術框架。

awesome latex drawing

27.Gensim是一個Python庫,用於主題建模,文檔索引和大型語料庫的類似性檢索。 目標受衆是天然語言處理(NLP)和信息檢索(IR)社區。

gensim

28.R語言包chromote,Chromote是Chrome Devtools協議的R實現。 它適用於Chrome,Chromium,Opera,Vivaldi和其餘基於Chromium的瀏覽器。 默認狀況下,它使用谷歌瀏覽器(必須已安裝在系統上)。

chromote

29.R語言包bench,目標是對代碼進行基準測試,跟蹤執行時間,內存分配和垃圾收集。

bench

30.Python + NumPy程序的可組合轉換:區分,矢量化,JIT到GPU / TPU等。

jax

31.geosnap是一個開源的Python3軟件包,用於探索,建模和可視化鄰域動態。geosnap旨在幫助填補這些空白。 它提供了一套工具,用於建立社會空間數據集,將這些數據集協調爲一致的時間 - 靜態邊界集,並使用經典和空間統計方法對鄰域變化進行建模。

geosnap

32.一個輕量的工具集合。

MikuTools

33.GDAL的js版本。

gdaljs

34.瀏覽器中的GDAL Javascript包裝器。

loam

35.關於如何寫學術論文review的倉庫。

reviews

36.R語言包factory,目標是使函數的構建更加簡單,而無需用戶學習rlang包。

factory

37.Cmder是一個軟件包,因爲在Windows上缺乏可用的控制檯模擬器而徹底失敗。 它基於ConEmu的主要配置大修,配備Monokai配色方案,驚人的碰撞(經過碰撞完成進一步加強)和自定義提示佈局。

cmder

38.可用於Shiny和Rmarkdown的titian圖標。

titanicon

39.R語言包dashR,用於建立響應式Web應用程序的Dash生態系統的R接口。

dashR

40.R語言包dtplyr,dtplyr爲data.table提供了一個dplyr後端。 dtplyr的目標是容許您編寫自動轉換爲等效但一般更快的data.table代碼的dplyr代碼。

dtplyr

2 Paper:

1.Globally analysing spatiotemporal trends of anthropogenic PM2.5 concentration and population's PM2.5 exposure from 1998 to 2016/從1998年到2016年人爲PM2.5濃度和人口PM2.5暴露的時空趨勢全球分析

顆粒物(PM)形式的空氣污染正在成爲全球範圍內對人類健康的最大威脅之一。本文首先提出了一種貝葉斯時空等級分段迴歸模型(BSTHPRM),它能夠自適應地檢測局部趨勢的轉變,從而解釋空間相關性。經過提出的BSTHPRM研究了1998年至2016年全球大陸近似人爲PM2.5去除自然塵埃(PM2.5 No塵)濃度和相應人羣PM2.5 No粉塵暴露(PPM2.5E)的時空趨勢。 PM2.5 No塵埃污染嚴重的地區的總面積,其PM2.5 No污染對全球大陸整體水平的空間相對大小在1.89和14.68之間,佔全球陸地面積的13.4%,相應的暴露人口占全球總人口的56.0%。全球PM2.5 No污染的空間異質性從1998年到2016年廣泛增長。隨着PM2.5 No濃度趨勢的增長,熱點,暖點和冷點的面積最初收縮,而後擴大。全球大陸PM2.5 NoDust濃度和PPM2.5E的局部趨勢可使用BSTHPRM分爲三個變化階段,早期,中期和後期。 PM2.5 No濃度和PPM2.5E呈降低趨勢的區域面積比例在中期比早期和後期更大。印度北部和中國東部和南部兩個較高PM2.5 No污染區PM2.5 No濃度和PPM2.5E的局部趨勢在早期增長,而後在中期減小。在後期(近年),印度北部呈增加趨勢;儘管如此,中國東部和南部的後續降低趨勢仍然存在。在前兩個階段,歐洲一半以上的地區經歷了PM2.5 NoDust濃度和PPM2.5E的降低趨勢;後來,歐洲一半以上的地區在後期呈現出愈來愈大的趨勢。北美和南美經歷了與歐洲類似的PPM2.5E局部趨勢。在研究期間,非洲的PPM2.5E趨勢廣泛增長。發表於EI上的PM2.5濃度分析與人口暴露的研究。採用了一個貝葉斯的時空模型用於PM2.5空間分佈建模,貝葉斯時空統計是近年來時空統計方向重要建模手段,這篇文章也是一個頗有意思的研究。

2.Testing the Efficiency of Using High-Resolution Data From GF-1 in Land Cover Classifications/在土地覆蓋分類中測試從GF-1使用高分辨率數據的效率

高分辨率遙感在研究地球表層變化方面發揮着重要做用。新軌道的中國GF-1衛星旨在以區域尺度觀測地球表層;可是,衛星效率須要進一步調查。在本文中,經過考慮補充信息和不一樣的土地覆蓋分類方法,測試了使用GF-1 01衛星圖像監測複雜表面的效率。咱們的工做代表,GF-1衛星觀測能夠有效地探測土地覆蓋碎片。當應用支持向量機方法時,基於多源數據的整體分類精度達到90.5%。在分類圖像中有效地減小了「鹽和胡椒現象」。這些結果還代表GF-1圖像分類的準確性優於使用Landsat 8和Sentinel-2A圖像的相同方法的結果,整體分類準確度增長了23.6%和13.6%。咱們的研究代表,GF-1衛星觀測適用於複雜陸地表面的土地覆蓋研究。這種方法可使各類相關領域受益,例如土地資源調查,生態評估,環境評估等。探究了GF-1國產衛星在陸地表層對地觀測的應用。GF-1衛星有效提高本來衛星監測精度,是一個很重要的衛星數據來源。

3.An Improved Single-Channel Polar Region Ice Surface Temperature Retrieval Algorithm Using Landsat-8 Data/利用Landsat-8數據改進單通道極區冰面溫度反演算法

冰面溫度(IST)是研究極地冰蓋和冰架的關鍵參數。在本研究中,提出了一種基於輻射傳輸方程的改進單通道(ISC)算法,用於從Landsat-8頻段10數據中進行IST檢索。提出的ISC算法的主要步驟包括:1)經過迴歸大氣水汽含量和有效平均大氣溫度來模擬大氣輻射參數; 2)使用普朗克方程計算IST,而不是使用泰勒近似; 3)實現IST計算的迭代方案。定量估計了使用泰勒近似和大氣輻射參數模擬的偏差。還進行了ISC對大氣水汽含量,亮度溫度和衛星觀測中可能的偏差的靈敏度分析。靈敏度分析結果代表,該算法對大氣水汽含量具備較強的魯棒性,但對熱紅外傳感器的校準精度較爲敏感。使用模擬方法進行的驗證顯示,ISC的IST變異性優於原始SC算法[均方根偏差(RMSEs)分別爲0.3252和0.7176 K]。與格陵蘭68個自動氣象站數據和南極25個數據的近地面氣溫相比,ISC算法的誤差和RMSE再次優於SC算法。發現中等分辨率成像光譜儀(MODIS)的IST與SC和ISC算法的結果相比被低估了。提出了從Landsat-8圖像樣本獲得的IST空間分佈圖。還提出了所提出的ISC算法中的每一個步驟的基本原理,以便這能夠爲結果的真實性提供進一步的支持。發表在IEEE TGRS頂刊上的溫度遙感反演算法,改進Landsat-8的單通道溫度反演算法,很是不錯的研究。

4.Impacts of air pollutants from rural Chinese households under the rapid residential energy transition/家庭能源快速轉型下中國農村家庭大氣污染物的影響

家庭固體燃料的使用構成了大量的空氣污染,但在過去三十年中逐漸被其餘清潔能源所取代。 在這裏,做者調查了農村家庭對環境PM2.5污染的貢獻以及由此產生的氣候強迫和健康影響,並發現農村家庭使用的剩餘大量固體燃料仍然是環境空氣污染的主要緣由,儘管 因爲清潔的能源轉換,其污染物排放量減小以及對PM2.5的相對貢獻。發表於Nature Communication的文章,來自陶澍院士團隊的成果,分析農村家庭燃煤對於PM2.5和睦候強迫的影響。事實上PM2.五、氣溶膠與氣候有着密不可分的聯繫,這是一個很是複雜的海陸氣耦合綜合問題,將來的研究應當關注PM2.5與氣候強迫的一些研究。

5.Quantitative estimates of collective geo-tagged human activities in response to typhoon Hato using location-aware big data/使用位置感知大數據定量估計對臺風Hato響應的集體地理標記人類活動

來自社交媒體的位置感知大數據已普遍用於定量描述天然災害和災害形成的損失。目前尚不清楚人類活動如何共同應對災難。在這項研究中,咱們使用聚合位置請求數據檢查了在多個空間尺度上響應颱風哈託的集體人類活動。咱們提出了一種多級突變檢測(MACD)方法框架,用於檢測和表徵響應Typhoon Hato的位置請求的忽然變化。結果代表,在網格水平上,大多數異常網格位於颱風軌跡周圍53千米半徑範圍內。在城市一級,人類活動恢復持續時間(平均230小時)存在顯着的空間差別。在地方一級,忽然的位置要求變化的絕對幅度與颱風引發的經濟損失和受影響的人口密切相關。基於社交媒體大數據與災害應急方面的研究,分析了不一樣尺度下的影響,利用社交媒體數據定量估計人類活動將爲防災減災提供重要的數據支撐。

6.Committed emissions from existing energy infrastructure jeopardize 1.5 °C climate target/現有能源基礎設施的承諾排放危及1.5°C氣候目標

到本世紀中葉(2050年),淨人爲二氧化碳(CO2)排放必須達到零,以將全球平均溫度穩定在國際努力所針對的水平1-5。然而,化石燃料能源基礎設施的持續擴張意味着已經「承諾」的將來二氧化碳排放。在這裏,咱們使用2018年當前化石燃料燃燒能源基礎設施的詳細數據集來估算「承諾的」二氧化碳排放的區域和部門模式,此類排放對假定的運行壽命和時間表的敏感性,以及相關基礎設施的經濟價值。咱們估計,若是按歷史運營,現有基礎設施將排放大約658億噸(Gt)的二氧化碳(取決於假定的壽命和利用率,從226到1,479 Gt二氧化碳)。預計這些排放中有一半以上來自電力部門,中國,美國和歐盟28國的基礎設施分別約佔總數的41%,9%和7%。若是建成,擬議的發電廠(計劃,容許或正在建設中)將排放大約額外的188(範圍37-427)Gt CO2。若是將平均變暖限制在1.5°C,機率爲50-66%(420-580 Gt CO2),現有和擬議的能源基礎設施(約846 Gt CO2)的承諾排放量將超過整個剩餘的碳預算。若是將平均變暖限制在2°C如下(1,170-1,500 Gt CO2)5,則多是剩餘碳預算的三分之二。剩餘的碳預算估計是多種多樣的,細微差異,取決於氣候目標和大規模負排放的可用性。儘管如此,咱們的排放估算代表,不多或根本沒有額外的二氧化碳排放基礎設施,爲了符合「巴黎協定」,可能須要早於歷史基礎設施退役(或採用碳捕集與封存技術的改造)。據每噸承諾排放的資產價值,咱們估計,若是非排放替代技術可用且價格合理,那麼最具成本效益的過早基礎設施退役將在電力和工業部門進行。Nature上的一篇文章,探究能源基礎設施數量、排放規模對於巴黎協定減排目標的影響,這些結果代表目前具備很是大的減排壓力。氣候變化仍舊道阻且長,固然carbon budget的估算方式仍然有多種多樣。

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