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生信自學筆記(六)Needleman-Wunsch算法的python實現
時間 2020-01-29
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Needleman-Wunsch算法是一種全局聯配算法,原理提及來不算難,就是首先把兩條目標DNA序列的最前面加一個空格表明空位,而後畫一個大小爲(一條DNA序列長度*另外一條DNA序列的長度)的矩陣,矩陣橫縱座標分別表明對應序列的鹼基或是空位,這樣就能夠依據打分規則把這個矩陣填充起來。python 而矩陣的初始化方法是這樣的,首先填完第一行和第一列,也就是簡單的其中一個是空位的配對狀況,而後依次
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