關於3D Slicer的下載、安裝及模塊安裝在上一篇博客中以及介紹過,如下將專一於使用3D Slicer進行顱骨去除html
這次,咱們須要安裝SwissSkullStripper模塊,安裝後須要重啓軟件才能使用該模塊htm
使用SwissSkullStripper模塊,如圖劃線部分,點擊Help,會出現藍色連接,點擊可進入官網
blog
在官網界面,咱們能夠看到兩個下載連接,這兩個圖譜文件(atlas image、atlas brain mask)是咱們進行接下來操做須要使用的
ip
下載下來以後把它們保存在無中文名字的文件夾內待用,並修改文件名分別爲Atlas.mha和AtlasMask-label.mha(atlas image.mha -> Atlas.mha,atlas brain mask -> AtlasMask-label.mha)get
在3D Slicer中分別載入須要進行顱骨去除的文件和剛剛下載的兩個備用文件博客
點擊File,點擊Add Data便可出現下面載入文件的界面,將上述文件導入便可
軟件
最後一次在選擇Input, Output 和 Atlas,最後點擊Apply,便可生成去除顱骨的圖像
下載
注意Output最好選擇Create new Volume,這樣生成的文件不會覆蓋咱們以前導入的文件。Altas部分就是導入咱們以前在官網下載的兩個圖譜文件im
效果
img