「基因組組裝」三代組裝多少深度比較合適

文章 一句話總結，組裝深度建議高於30X，N50建議高於11Kb，否則會出現嚴重的片段化。 最初參加三代組裝培訓的時候，課程老師建議Canu使用所有數據進行組裝會比較好。因爲我組裝基因組比較小，計算成本低，所以大部分的時候我都是用100X左右的數據進行糾錯加組裝。但是最近組裝的時候，卻發現如果我使用所有數據，最後結果會有更多的錯誤組裝。這種錯誤可以用一個成語進行概括，「三人成虎」，也就是原本不應該

>>阅读原文<<