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使用EPIC預測腫瘤微環境中免疫細胞構成
時間 2021-01-14
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歡迎關注」生信修煉手冊」! 在傳統的RNA_seq測序中,每個樣本取樣後實際包含了成千上萬個細胞,和單細胞測序的single cell相比,這樣的樣本稱之爲bulk samples。在bulk samples的這麼多細胞中,可能包含來自多個細胞亞羣。 在腫瘤組織中,由於腫瘤微環境中各種細胞的浸潤,其RNA_seq的樣本中必然存在了腫瘤細胞,浸潤的免疫細胞等多種細胞亞羣。爲了準確的評估腫瘤微環境中免
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