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利用leafcutter做可變剪切(新手向)
時間 2021-01-20
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本文參考於生信技能樹 利用leafcutter做可變剪切需要的材料是RNA-seq流程中所獲得的bam類型的文件 首先是軟件的安裝: 1.源代碼下載 git clone https://github.com/davidaknowles/leafcutter #這條命令下載該軟件的源代碼,需要修改裏面的一個腳本 scripts/bam2junc.sh 把軟件路徑增添進去即可,並將該軟件路徑添加到環境
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