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用R語言繪製顯示taxa特徵值的散點圖
時間 2021-01-13
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在系統發育分析時,經常會對樹上taxa的性狀進行描述性統計。對於離散型的變量,R中各種包(APE,phytools,etc)自帶的函數可以較好解決問題,但對於連續型變量(如體長、體重等),則沒有對應的函數進行顯示。 其實,可以通過Hmisc包中的dotchart3函數繪製「克利夫蘭點圖」,再將其拼接到系統發育樹上解決此問題。效果如下圖: 圖中,系統發育樹右側的dot p
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