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GTRD:最全面的人和小鼠轉錄因子chip_seq數據庫
時間 2021-01-20
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歡迎關注」生信修煉手冊」! GTRD從SRA, GEO, ENCODE等公共數據庫中收集轉錄因子相關的chip_seq數據,採用標準流程進行peak calling分析,並基於已有的轉錄因子motif數據,預測了轉錄因子結合位點TFBS, 數據庫網址如下 http://gtrd.biouml.org/ 整個數據庫構建的pipeline示意如下 採用bowtie2將reads與基因組進行比對,並利用
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