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基於距離譜的DE增強蛋白質構象空間採樣
時間 2021-01-03
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蛋白質的從頭預測方法的目的就是尋找低能量構象,一般來說,天然構象置於蛋白質能量的最低值。 在這篇論文裏,衡量構象的方法不僅包含蛋白質構象的能量,還考慮了殘基間的距離。 當試驗構象的能量大於目標構象能量時,計算每個殘基對之間的距離和距離譜中相應的距離之間的平均 距離誤差。如果試驗構象相比目標構象獲得的平均誤差更小,則根據距離譜設計試驗構象的接收概率。 距離譜(distance profile) i和
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