TACO - 使用cuffmerge進行轉錄本拼接時你可能還不知道你在犯錯

在分析RNA-seq數據時,你經常可能會需要使用cufflink或stringtie兩個軟件進行轉錄組組裝,用於預測新的轉錄本,這兩個軟件是RNA-seq分析中進行有參轉錄本組裝的最最最常用到的軟件了,同時他們也自帶了工具(cuffmerge和stringtie -merge)用於將組裝好的轉錄本進行拼接,經典分析流程基本上就是: tophat + cufflink + cuffmerge + c
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