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WGS,WES,RNA-seq組與ChIP-seq之間的異同
時間 2021-01-06
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1 基礎概念 平均測序深度: 指定區域內得到的所有鹼基數目與該區域的長度的比值,如果是全基因組,就是整個測序的鹼基數目除以基因組的大小。比如人類的基因組大小是3G(30億個鹼基),我的全基因組測序共8.9億條150bp的reads,那麼全基因組範圍的平均測序深度就是8.9億*150/30億~45X,這個概念很重要! 覆蓋度: 指測序獲得的序列佔整個基因組(或者指定區域)的比例。由於基因組中的高GC
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