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bedGraph,bed以及bam文件格式轉換
時間 2019-12-13
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感興趣的基因信息包含在bedGraph文件中,下面命令是對其文件格式進行轉換,通常進行到bam文件可視化的效果比較好。工具 1. bedGraph轉bed文件 BedGraph ,的數據和bed文件很相似,ChIPseq數據作完peak calling後的bed文件最短只有三列,染色體序號,染色體起始位置和結束位置。以下所示,前面的聲明和Wig相似,後面的四列分別表示染色體序號,起始位置,結束位置
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