RPKM與TPM值的區別

對於RNA-Seq，目前主流還是用RPKM/FPKM來形容一個基因的表達量。有人說TPM更好。 RPKM定義：有一個基因A，它在這個樣本的轉錄組數據中被測序而且mapping到基因組了 5000個的reads，而這個基因A長度是10K，我們總測序文庫是50M，所以這個基因A的RPKM值是 5000除以10，再除以50，爲10. 就是把基因的reads數量根據基因長度和樣本測序文庫來標準化（norm

>>阅读原文<<