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基因數據處理123之SSW代碼不正確,到時比SparkSW時間長
時間 2019-12-04
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sparksw
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更多代碼請見:https://github.com/xubo245git 基因數據處理系列github 1.解釋 因爲要生成新的score matrix:blosum50,第一次使用靜態方法,直接傳給align,到時每次運行都須要進行一次score matrix的計算,而這個是將blosum50的矩陣轉換成128*128的矩陣,當計算Q0,即8個字符串的query時,顯然時間佔比大,原本序列比對時
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