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確定RNA-seq鏈特異性
時間 2021-07-13
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當需要確定鏈特異性時,可如下操作,需要安裝bedops, rseqc兩個程序。 安裝bedops, rseqc Conda install bedops Conda install rseqc 將比對過程中使用的gtf文件轉爲12列的bed文件 在bedops中有gtf2bed可以將gft轉換爲12列的bed文件。 輸入命令: gtf2bed < Mus_musculus.GRCm38.93.ch
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