Samtools(CentOS Linux)安裝及常用命令詳解

序列比對(將測序reads與已知序列信息的基因或基因組進行比對)是高通量測序數據分析中最重要的一環,無論是轉錄組還是重測序都是基於比對結果來進行後續各項分析的,比對結果格式比較常見的是sam和bam文件,例如轉錄組Tophat分析軟件輸出的比對結果爲.bam文件,而重測序中BWA、bowtie等比對軟件則主要輸出爲.sam文件。 samtools是一個用於操作sam和bam文件的工具軟件,能夠對比
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