精心整理（含圖版）|你要的全拿走！（R數據分析，可視化，生信實戰）

 

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一 R資料+計劃

R語言精品資料年中無套路贈送

R-plotly|交互式甘特圖（Gantt chart）-項目管理/學習計劃

 

二 Bioinfo

R|fastqcr QC數據處理 ：測序結果的數據質控及圖標展現；

Bioinfo|bedtools-操做VCF文件 VCF文件的常見合併，過濾等操做；

 

R|生存分析（1） ：生存分析介紹以及R實現，KM繪圖；

R|生存分析-結果整理 ：一鍵式輸出全部變量的COX結果；

R|timeROC-分析 ：時間依賴的生存分析；

Nomogram（諾莫圖） | Logistic、Cox生存分析結果可視化

Forest plot（森林圖） | Cox生存分析可視化

R-forestplot包| HR結果繪製森林圖

maftools|TCGA腫瘤突變數據的彙總，分析和可視化

maftools | 從頭開始繪製發表級oncoplot（瀑布圖）

ggalluvial|炫酷桑基圖（Sankey），你也能夠秀

pheatmap|暴雨暫歇，「熱圖」來襲！！！

ggplot2-plotly|讓你的火山圖「活」過來

R|clusterProfiler-富集分析

ggplot2| 繪製KEGG氣泡圖

ggplot2|繪製GO富集柱形圖

ggplot2|從0開始繪製PCA圖

Bio|manhattan圖

 

 

三 base + ggplot2

R|繪圖邊距及佈局

R-基本繪圖參數（Ⅰ）

ggplot2|詳解八大基本繪圖要素

ggplot2|theme主題設置，詳解繪圖優化-「精雕細琢」

ggplot2 |legend參數設置，圖形精雕細琢

ggplot2|從0開始繪製直方圖

ggplot2|從0開始繪製折線圖

ggplot2|從0開始繪製箱線圖

繪圖系列|R-corrplot相關圖

繪圖系列|R-wordcloud2包繪製詞雲

繪圖系列|R-VennDiagram包繪製韋恩圖

ggplot2|發散性「正負」圖

R|UpSet-集合可視化

ggplot2|ggpubr進行「paper」組圖合併

ggplot2|擴展包從0開始繪製雷達圖

R|plotly

 

四 數據分析

R|批量循環處理同一格式文件-csv,txt,excel

R In Action |基本數據管理

數據分析|R-缺失值處理

數據分析|R-異常值處理

數據分析|R-描述性統計

小數據| 描述性統計（Python/R 實現）

數據挖掘|R-相關性分析及檢驗

數據處理 | R-tidyr包

數據處理|R-dplyr

R|apply，tapply

數據處理|數據框重鑄

R|ML_code-入門（1）

R|ML_code-線性迴歸（2）

R|機器學習入門-多元線性迴歸（3）

 

五 其餘

1，年中定一個小計劃，三個系列繼續隨着學習更新；

2，Python 數據處理和生信應用示例系列；

3，機器學習基礎算法應用生信分析實例（R & Python）；

 

目標不變，但願能比較持續，系統的學習，輸出帶動輸入！

 

對了，部分文末有代碼或者數據的獲取方式，看到後按提示回覆便可！

 

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