Spark性能調優-高級篇

前言

基礎篇講解了每一個Spark開發人員都必須熟知的開發調優與資源調優以後,本文做爲《Spark性能優化指南》的高級篇,將深刻分析數據傾斜調優與shuffle調優,以解決更加棘手的性能問題。html

數據傾斜調優

調優概述

有的時候,咱們可能會遇到大數據計算中一個最棘手的問題——數據傾斜,此時Spark做業的性能會比指望差不少。數據傾斜調優,就是使用各類技術方案解決不一樣類型的數據傾斜問題,以保證Spark做業的性能。算法

數據傾斜發生時的現象

  • 絕大多數task執行得都很是快,但個別task執行極慢。好比,總共有1000個task,997個task都在1分鐘以內執行完了,可是剩餘兩三個task卻要一兩個小時。這種狀況很常見。sql

  • 本來可以正常執行的Spark做業,某天忽然報出OOM(內存溢出)異常,觀察異常棧,是咱們寫的業務代碼形成的。這種狀況比較少見。後端

數據傾斜發生的原理

數據傾斜的原理很簡單:在進行shuffle的時候,必須將各個節點上相同的key拉取到某個節點上的一個task來進行處理,好比按照key進行聚合或join等操做。此時若是某個key對應的數據量特別大的話,就會發生數據傾斜。好比大部分key對應10條數據,可是個別key卻對應了100萬條數據,那麼大部分task可能就只會分配到10條數據,而後1秒鐘就運行完了;可是個別task可能分配到了100萬數據,要運行一兩個小時。所以,整個Spark做業的運行進度是由運行時間最長的那個task決定的。性能優化

所以出現數據傾斜的時候,Spark做業看起來會運行得很是緩慢,甚至可能由於某個task處理的數據量過大致使內存溢出。網絡

舉一個很清晰的例子:hello這個key,在三個節點上對應了總共7條數據,這些數據都會被拉取到同一個task中進行處理;而world和you這兩個key分別纔對應1條數據,因此另外兩個task只要分別處理1條數據便可。此時第一個task的運行時間多是另外兩個task的7倍,而整個stage的運行速度也由運行最慢的那個task所決定。數據結構

 

如何定位致使數據傾斜的代碼

數據傾斜只會發生在shuffle過程當中。這裏給你們羅列一些經常使用的而且可能會觸發shuffle操做的算子:distinct、groupByKey、reduceByKey、aggregateByKey、join、cogroup、repartition等。出現數據傾斜時,可能就是你的代碼中使用了這些算子中的某一個所致使的。app

某個task執行特別慢的狀況

首先要看的,就是數據傾斜發生在第幾個stage中。dom

若是是用yarn-client模式提交,那麼本地是直接能夠看到log的,能夠在log中找到當前運行到了第幾個stage;若是是用yarn-cluster模式提交,則能夠經過Spark Web UI來查看當前運行到了第幾個stage。此外,不管是使用yarn-client模式仍是yarn-cluster模式,咱們均可以在Spark Web UI上深刻看一下當前這個stage各個task分配的數據量,從而進一步肯定是否是task分配的數據不均勻致使了數據傾斜。ide

好比下圖中,倒數第三列顯示了每一個task的運行時間。明顯能夠看到,有的task運行特別快,只須要幾秒鐘就能夠運行完;而有的task運行特別慢,須要幾分鐘才能運行完,此時單從運行時間上看就已經可以肯定發生數據傾斜了。此外,倒數第一列顯示了每一個task處理的數據量,明顯能夠看到,運行時間特別短的task只須要處理幾百KB的數據便可,而運行時間特別長的task須要處理幾千KB的數據,處理的數據量差了10倍。此時更加可以肯定是發生了數據傾斜。

知道數據傾斜發生在哪個stage以後,接着咱們就須要根據stage劃分原理,推算出來發生傾斜的那個stage對應代碼中的哪一部分,這部分代碼中確定會有一個shuffle類算子。精準推算stage與代碼的對應關係,須要對Spark的源碼有深刻的理解,這裏咱們能夠介紹一個相對簡單實用的推算方法:只要看到Spark代碼中出現了一個shuffle類算子或者是Spark SQL的SQL語句中出現了會致使shuffle的語句(好比group by語句),那麼就能夠斷定,以那個地方爲界限劃分出了先後兩個stage。

這裏咱們就以Spark最基礎的入門程序——單詞計數來舉例,如何用最簡單的方法大體推算出一個stage對應的代碼。以下示例,在整個代碼中,只有一個reduceByKey是會發生shuffle的算子,所以就能夠認爲,以這個算子爲界限,會劃分出先後兩個stage。

  • stage0,主要是執行從textFile到map操做,以及執行shuffle write操做。shuffle write操做,咱們能夠簡單理解爲對pairs RDD中的數據進行分區操做,每一個task處理的數據中,相同的key會寫入同一個磁盤文件內。
  • stage1,主要是執行從reduceByKey到collect操做,stage1的各個task一開始運行,就會首先執行shuffle read操做。執行shuffle read操做的task,會從stage0的各個task所在節點拉取屬於本身處理的那些key,而後對同一個key進行全局性的聚合或join等操做,在這裏就是對key的value值進行累加。stage1在執行完reduceByKey算子以後,就計算出了最終的wordCounts RDD,而後會執行collect算子,將全部數據拉取到Driver上,供咱們遍歷和打印輸出。
val conf = new SparkConf()
val sc = new SparkContext(conf)

val lines = sc.textFile("hdfs://...")
val words = lines.flatMap(_.split(" "))
val pairs = words.map((_, 1))
val wordCounts = pairs.reduceByKey(_ + _)

wordCounts.collect().foreach(println(_))

經過對單詞計數程序的分析,但願可以讓你們瞭解最基本的stage劃分的原理,以及stage劃分後shuffle操做是如何在兩個stage的邊界處執行的。而後咱們就知道如何快速定位出發生數據傾斜的stage對應代碼的哪個部分了。好比咱們在Spark Web UI或者本地log中發現,stage1的某幾個task執行得特別慢,斷定stage1出現了數據傾斜,那麼就能夠回到代碼中定位出stage1主要包括了reduceByKey這個shuffle類算子,此時基本就能夠肯定是由educeByKey算子致使的數據傾斜問題。好比某個單詞出現了100萬次,其餘單詞纔出現10次,那麼stage1的某個task就要處理100萬數據,整個stage的速度就會被這個task拖慢。

某個task莫名其妙內存溢出的狀況

這種狀況下去定位出問題的代碼就比較容易了。咱們建議直接看yarn-client模式下本地log的異常棧,或者是經過YARN查看yarn-cluster模式下的log中的異常棧。通常來講,經過異常棧信息就能夠定位到你的代碼中哪一行發生了內存溢出。而後在那行代碼附近找找,通常也會有shuffle類算子,此時極可能就是這個算子致使了數據傾斜。

可是你們要注意的是,不能單純靠偶然的內存溢出就斷定發生了數據傾斜。由於本身編寫的代碼的bug,以及偶然出現的數據異常,也可能會致使內存溢出。所以仍是要按照上面所講的方法,經過Spark Web UI查看報錯的那個stage的各個task的運行時間以及分配的數據量,才能肯定是不是因爲數據傾斜才致使了此次內存溢出。

查看致使數據傾斜的key的數據分佈狀況

知道了數據傾斜發生在哪裏以後,一般須要分析一下那個執行了shuffle操做而且致使了數據傾斜的RDD/Hive表,查看一下其中key的分佈狀況。這主要是爲以後選擇哪種技術方案提供依據。針對不一樣的key分佈與不一樣的shuffle算子組合起來的各類狀況,可能須要選擇不一樣的技術方案來解決。

此時根據你執行操做的狀況不一樣,能夠有不少種查看key分佈的方式:

  1. 若是是Spark SQL中的group by、join語句致使的數據傾斜,那麼就查詢一下SQL中使用的表的key分佈狀況。
  2. 若是是對Spark RDD執行shuffle算子致使的數據傾斜,那麼能夠在Spark做業中加入查看key分佈的代碼,好比RDD.countByKey()。而後對統計出來的各個key出現的次數,collect/take到客戶端打印一下,就能夠看到key的分佈狀況。

舉例來講,對於上面所說的單詞計數程序,若是肯定了是stage1的reduceByKey算子致使了數據傾斜,那麼就應該看看進行reduceByKey操做的RDD中的key分佈狀況,在這個例子中指的就是pairs RDD。以下示例,咱們能夠先對pairs採樣10%的樣本數據,而後使用countByKey算子統計出每一個key出現的次數,最後在客戶端遍歷和打印樣本數據中各個key的出現次數。

val sampledPairs = pairs.sample(false, 0.1)
val sampledWordCounts = sampledPairs.countByKey()
sampledWordCounts.foreach(println(_))

數據傾斜的解決方案

解決方案一:使用Hive ETL預處理數據

方案適用場景:致使數據傾斜的是Hive表。若是該Hive表中的數據自己很不均勻(好比某個key對應了100萬數據,其餘key纔對應了10條數據),並且業務場景須要頻繁使用Spark對Hive表執行某個分析操做,那麼比較適合使用這種技術方案。

方案實現思路:此時能夠評估一下,是否能夠經過Hive來進行數據預處理(即經過Hive ETL預先對數據按照key進行聚合,或者是預先和其餘表進行join),而後在Spark做業中針對的數據源就不是原來的Hive表了,而是預處理後的Hive表。此時因爲數據已經預先進行過聚合或join操做了,那麼在Spark做業中也就不須要使用原先的shuffle類算子執行這類操做了。

方案實現原理:這種方案從根源上解決了數據傾斜,由於完全避免了在Spark中執行shuffle類算子,那麼確定就不會有數據傾斜的問題了。可是這裏也要提醒一下你們,這種方式屬於治標不治本。由於畢竟數據自己就存在分佈不均勻的問題,因此Hive ETL中進行group by或者join等shuffle操做時,仍是會出現數據傾斜,致使Hive ETL的速度很慢。咱們只是把數據傾斜的發生提早到了Hive ETL中,避免Spark程序發生數據傾斜而已。

方案優勢:實現起來簡單便捷,效果還很是好,徹底規避掉了數據傾斜,Spark做業的性能會大幅度提高。

方案缺點:治標不治本,Hive ETL中仍是會發生數據傾斜。

方案實踐經驗:在一些Java系統與Spark結合使用的項目中,會出現Java代碼頻繁調用Spark做業的場景,並且對Spark做業的執行性能要求很高,就比較適合使用這種方案。將數據傾斜提早到上游的Hive ETL,天天僅執行一次,只有那一次是比較慢的,而以後每次Java調用Spark做業時,執行速度都會很快,可以提供更好的用戶體驗。

項目實踐經驗:在美團·點評的交互式用戶行爲分析系統中使用了這種方案,該系統主要是容許用戶經過Java Web系統提交數據分析統計任務,後端經過Java提交Spark做業進行數據分析統計。要求Spark做業速度必需要快,儘可能在10分鐘之內,不然速度太慢,用戶體驗會不好。因此咱們將有些Spark做業的shuffle操做提早到了Hive ETL中,從而讓Spark直接使用預處理的Hive中間表,儘量地減小Spark的shuffle操做,大幅度提高了性能,將部分做業的性能提高了6倍以上。

解決方案二:過濾少數致使傾斜的key

方案適用場景:若是發現致使傾斜的key就少數幾個,並且對計算自己的影響並不大的話,那麼很適合使用這種方案。好比99%的key就對應10條數據,可是隻有一個key對應了100萬數據,從而致使了數據傾斜。

方案實現思路:若是咱們判斷那少數幾個數據量特別多的key,對做業的執行和計算結果不是特別重要的話,那麼幹脆就直接過濾掉那少數幾個key。好比,在Spark SQL中可使用where子句過濾掉這些key或者在Spark Core中對RDD執行filter算子過濾掉這些key。若是須要每次做業執行時,動態斷定哪些key的數據量最多而後再進行過濾,那麼可使用sample算子對RDD進行採樣,而後計算出每一個key的數量,取數據量最多的key過濾掉便可。

方案實現原理:將致使數據傾斜的key給過濾掉以後,這些key就不會參與計算了,天然不可能產生數據傾斜。

方案優勢:實現簡單,並且效果也很好,能夠徹底規避掉數據傾斜。

方案缺點:適用場景很少,大多數狀況下,致使傾斜的key仍是不少的,並非只有少數幾個。

方案實踐經驗:在項目中咱們也採用過這種方案解決數據傾斜。有一次發現某一天Spark做業在運行的時候忽然OOM了,追查以後發現,是Hive表中的某一個key在那天數據異常,致使數據量暴增。所以就採起每次執行前先進行採樣,計算出樣本中數據量最大的幾個key以後,直接在程序中將那些key給過濾掉。

解決方案三:提升shuffle操做的並行度

方案適用場景:若是咱們必需要對數據傾斜迎難而上,那麼建議優先使用這種方案,由於這是處理數據傾斜最簡單的一種方案。

方案實現思路:在對RDD執行shuffle算子時,給shuffle算子傳入一個參數,好比reduceByKey(1000),該參數就設置了這個shuffle算子執行時shuffle read task的數量。對於Spark SQL中的shuffle類語句,好比group by、join等,須要設置一個參數,即spark.sql.shuffle.partitions,該參數表明了shuffle read task的並行度,該值默認是200,對於不少場景來講都有點太小。

方案實現原理:增長shuffle read task的數量,可讓本來分配給一個task的多個key分配給多個task,從而讓每一個task處理比原來更少的數據。舉例來講,若是本來有5個key,每一個key對應10條數據,這5個key都是分配給一個task的,那麼這個task就要處理50條數據。而增長了shuffle read task之後,每一個task就分配到一個key,即每一個task就處理10條數據,那麼天然每一個task的執行時間都會變短了。具體原理以下圖所示。

方案優勢:實現起來比較簡單,能夠有效緩解和減輕數據傾斜的影響。

方案缺點:只是緩解了數據傾斜而已,沒有完全根除問題,根據實踐經驗來看,其效果有限。

方案實踐經驗:該方案一般沒法完全解決數據傾斜,由於若是出現一些極端狀況,好比某個key對應的數據量有100萬,那麼不管你的task數量增長到多少,這個對應着100萬數據的key確定仍是會分配到一個task中去處理,所以註定仍是會發生數據傾斜的。因此這種方案只能說是在發現數據傾斜時嘗試使用的第一種手段,嘗試去用嘴簡單的方法緩解數據傾斜而已,或者是和其餘方案結合起來使用。

解決方案四:兩階段聚合(局部聚合+全局聚合)

方案適用場景:對RDD執行reduceByKey等聚合類shuffle算子或者在Spark SQL中使用group by語句進行分組聚合時,比較適用這種方案。

方案實現思路:這個方案的核心實現思路就是進行兩階段聚合。第一次是局部聚合,先給每一個key都打上一個隨機數,好比10之內的隨機數,此時原先同樣的key就變成不同的了,好比(hello, 1) (hello, 1) (hello, 1) (hello, 1),就會變成(1_hello, 1) (1_hello, 1) (2_hello, 1) (2_hello, 1)。接着對打上隨機數後的數據,執行reduceByKey等聚合操做,進行局部聚合,那麼局部聚合結果,就會變成了(1_hello, 2) (2_hello, 2)。而後將各個key的前綴給去掉,就會變成(hello,2)(hello,2),再次進行全局聚合操做,就能夠獲得最終結果了,好比(hello, 4)。

方案實現原理:將本來相同的key經過附加隨機前綴的方式,變成多個不一樣的key,就可讓本來被一個task處理的數據分散到多個task上去作局部聚合,進而解決單個task處理數據量過多的問題。接着去除掉隨機前綴,再次進行全局聚合,就能夠獲得最終的結果。具體原理見下圖。

方案優勢:對於聚合類的shuffle操做致使的數據傾斜,效果是很是不錯的。一般均可以解決掉數據傾斜,或者至少是大幅度緩解數據傾斜,將Spark做業的性能提高數倍以上。

方案缺點:僅僅適用於聚合類的shuffle操做,適用範圍相對較窄。若是是join類的shuffle操做,還得用其餘的解決方案。

// 第一步,給RDD中的每一個key都打上一個隨機前綴。
JavaPairRDD<String, Long> randomPrefixRdd = rdd.mapToPair(
        new PairFunction<Tuple2<Long,Long>, String, Long>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Tuple2<String, Long> call(Tuple2<Long, Long> tuple)
                    throws Exception {
                Random random = new Random();
                int prefix = random.nextInt(10);
                return new Tuple2<String, Long>(prefix + "_" + tuple._1, tuple._2);
            }
        });

// 第二步,對打上隨機前綴的key進行局部聚合。
JavaPairRDD<String, Long> localAggrRdd = randomPrefixRdd.reduceByKey(
        new Function2<Long, Long, Long>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Long call(Long v1, Long v2) throws Exception {
                return v1 + v2;
            }
        });

// 第三步,去除RDD中每一個key的隨機前綴。
JavaPairRDD<Long, Long> removedRandomPrefixRdd = localAggrRdd.mapToPair(
        new PairFunction<Tuple2<String,Long>, Long, Long>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Tuple2<Long, Long> call(Tuple2<String, Long> tuple)
                    throws Exception {
                long originalKey = Long.valueOf(tuple._1.split("_")[1]);
                return new Tuple2<Long, Long>(originalKey, tuple._2);
            }
        });

// 第四步,對去除了隨機前綴的RDD進行全局聚合。
JavaPairRDD<Long, Long> globalAggrRdd = removedRandomPrefixRdd.reduceByKey(
        new Function2<Long, Long, Long>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Long call(Long v1, Long v2) throws Exception {
                return v1 + v2;
            }
        });

解決方案五:將reduce join轉爲map join

方案適用場景:在對RDD使用join類操做,或者是在Spark SQL中使用join語句時,並且join操做中的一個RDD或表的數據量比較小(好比幾百M或者一兩G),比較適用此方案。

方案實現思路:不使用join算子進行鏈接操做,而使用Broadcast變量與map類算子實現join操做,進而徹底規避掉shuffle類的操做,完全避免數據傾斜的發生和出現。將較小RDD中的數據直接經過collect算子拉取到Driver端的內存中來,而後對其建立一個Broadcast變量;接着對另一個RDD執行map類算子,在算子函數內,從Broadcast變量中獲取較小RDD的全量數據,與當前RDD的每一條數據按照鏈接key進行比對,若是鏈接key相同的話,那麼就將兩個RDD的數據用你須要的方式鏈接起來。

方案實現原理:普通的join是會走shuffle過程的,而一旦shuffle,就至關於會將相同key的數據拉取到一個shuffle read task中再進行join,此時就是reduce join。可是若是一個RDD是比較小的,則能夠採用廣播小RDD全量數據+map算子來實現與join一樣的效果,也就是map join,此時就不會發生shuffle操做,也就不會發生數據傾斜。具體原理以下圖所示。

方案優勢:對join操做致使的數據傾斜,效果很是好,由於根本就不會發生shuffle,也就根本不會發生數據傾斜。

方案缺點:適用場景較少,由於這個方案只適用於一個大表和一個小表的狀況。畢竟咱們須要將小表進行廣播,此時會比較消耗內存資源,driver和每一個Executor內存中都會駐留一份小RDD的全量數據。若是咱們廣播出去的RDD數據比較大,好比10G以上,那麼就可能發生內存溢出了。所以並不適合兩個都是大表的狀況。

// 首先將數據量比較小的RDD的數據,collect到Driver中來。
List<Tuple2<Long, Row>> rdd1Data = rdd1.collect()
// 而後使用Spark的廣播功能,將小RDD的數據轉換成廣播變量,這樣每一個Executor就只有一份RDD的數據。
// 能夠儘量節省內存空間,而且減小網絡傳輸性能開銷。
final Broadcast<List<Tuple2<Long, Row>>> rdd1DataBroadcast = sc.broadcast(rdd1Data);

// 對另一個RDD執行map類操做,而再也不是join類操做。
JavaPairRDD<String, Tuple2<String, Row>> joinedRdd = rdd2.mapToPair(
        new PairFunction<Tuple2<Long,String>, String, Tuple2<String, Row>>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Tuple2<String, Tuple2<String, Row>> call(Tuple2<Long, String> tuple)
                    throws Exception {
                // 在算子函數中,經過廣播變量,獲取到本地Executor中的rdd1數據。
                List<Tuple2<Long, Row>> rdd1Data = rdd1DataBroadcast.value();
                // 能夠將rdd1的數據轉換爲一個Map,便於後面進行join操做。
                Map<Long, Row> rdd1DataMap = new HashMap<Long, Row>();
                for(Tuple2<Long, Row> data : rdd1Data) {
                    rdd1DataMap.put(data._1, data._2);
                }
                // 獲取當前RDD數據的key以及value。
                String key = tuple._1;
                String value = tuple._2;
                // 從rdd1數據Map中,根據key獲取到能夠join到的數據。
                Row rdd1Value = rdd1DataMap.get(key);
                return new Tuple2<String, String>(key, new Tuple2<String, Row>(value, rdd1Value));
            }
        });

// 這裏得提示一下。
// 上面的作法,僅僅適用於rdd1中的key沒有重複,所有是惟一的場景。
// 若是rdd1中有多個相同的key,那麼就得用flatMap類的操做,在進行join的時候不能用map,而是得遍歷rdd1全部數據進行join。
// rdd2中每條數據均可能會返回多條join後的數據。

解決方案六:採樣傾斜key並分拆join操做

方案適用場景:兩個RDD/Hive表進行join的時候,若是數據量都比較大,沒法採用「解決方案五」,那麼此時能夠看一下兩個RDD/Hive表中的key分佈狀況。若是出現數據傾斜,是由於其中某一個RDD/Hive表中的少數幾個key的數據量過大,而另外一個RDD/Hive表中的全部key都分佈比較均勻,那麼採用這個解決方案是比較合適的。

方案實現思路:

  • 對包含少數幾個數據量過大的key的那個RDD,經過sample算子採樣出一份樣原本,而後統計一下每一個key的數量,計算出來數據量最大的是哪幾個key。
  • 而後將這幾個key對應的數據從原來的RDD中拆分出來,造成一個單獨的RDD,並給每一個key都打上n之內的隨機數做爲前綴,而不會致使傾斜的大部分key造成另一個RDD。
  • 接着將須要join的另外一個RDD,也過濾出來那幾個傾斜key對應的數據並造成一個單獨的RDD,將每條數據膨脹成n條數據,這n條數據都按順序附加一個0~n的前綴,不會致使傾斜的大部分key也造成另一個RDD。
  • 再將附加了隨機前綴的獨立RDD與另外一個膨脹n倍的獨立RDD進行join,此時就能夠將原先相同的key打散成n份,分散到多個task中去進行join了。
  • 而另外兩個普通的RDD就照常join便可。
  • 最後將兩次join的結果使用union算子合併起來便可,就是最終的join結果。

方案實現原理:對於join致使的數據傾斜,若是隻是某幾個key致使了傾斜,能夠將少數幾個key分拆成獨立RDD,並附加隨機前綴打散成n份去進行join,此時這幾個key對應的數據就不會集中在少數幾個task上,而是分散到多個task進行join了。具體原理見下圖。

方案優勢:對於join致使的數據傾斜,若是隻是某幾個key致使了傾斜,採用該方式能夠用最有效的方式打散key進行join。並且只須要針對少數傾斜key對應的數據進行擴容n倍,不須要對全量數據進行擴容。避免了佔用過多內存。

方案缺點:若是致使傾斜的key特別多的話,好比成千上萬個key都致使數據傾斜,那麼這種方式也不適合。

// 首先從包含了少數幾個致使數據傾斜key的rdd1中,採樣10%的樣本數據。
JavaPairRDD<Long, String> sampledRDD = rdd1.sample(false, 0.1);

// 對樣本數據RDD統計出每一個key的出現次數,並按出現次數降序排序。
// 對降序排序後的數據,取出top 1或者top 100的數據,也就是key最多的前n個數據。
// 具體取出多少個數據量最多的key,由你們本身決定,咱們這裏就取1個做爲示範。
JavaPairRDD<Long, Long> mappedSampledRDD = sampledRDD.mapToPair(
        new PairFunction<Tuple2<Long,String>, Long, Long>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Tuple2<Long, Long> call(Tuple2<Long, String> tuple)
                    throws Exception {
                return new Tuple2<Long, Long>(tuple._1, 1L);
            }     
        });
JavaPairRDD<Long, Long> countedSampledRDD = mappedSampledRDD.reduceByKey(
        new Function2<Long, Long, Long>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Long call(Long v1, Long v2) throws Exception {
                return v1 + v2;
            }
        });
JavaPairRDD<Long, Long> reversedSampledRDD = countedSampledRDD.mapToPair( 
        new PairFunction<Tuple2<Long,Long>, Long, Long>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Tuple2<Long, Long> call(Tuple2<Long, Long> tuple)
                    throws Exception {
                return new Tuple2<Long, Long>(tuple._2, tuple._1);
            }
        });
final Long skewedUserid = reversedSampledRDD.sortByKey(false).take(1).get(0)._2;

// 從rdd1中分拆出致使數據傾斜的key,造成獨立的RDD。
JavaPairRDD<Long, String> skewedRDD = rdd1.filter(
        new Function<Tuple2<Long,String>, Boolean>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Boolean call(Tuple2<Long, String> tuple) throws Exception {
                return tuple._1.equals(skewedUserid);
            }
        });
// 從rdd1中分拆出不致使數據傾斜的普通key,造成獨立的RDD。
JavaPairRDD<Long, String> commonRDD = rdd1.filter(
        new Function<Tuple2<Long,String>, Boolean>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Boolean call(Tuple2<Long, String> tuple) throws Exception {
                return !tuple._1.equals(skewedUserid);
            } 
        });

// rdd2,就是那個全部key的分佈相對較爲均勻的rdd。
// 這裏將rdd2中,前面獲取到的key對應的數據,過濾出來,分拆成單獨的rdd,並對rdd中的數據使用flatMap算子都擴容100倍。
// 對擴容的每條數據,都打上0~100的前綴。
JavaPairRDD<String, Row> skewedRdd2 = rdd2.filter(
         new Function<Tuple2<Long,Row>, Boolean>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Boolean call(Tuple2<Long, Row> tuple) throws Exception {
                return tuple._1.equals(skewedUserid);
            }
        }).flatMapToPair(new PairFlatMapFunction<Tuple2<Long,Row>, String, Row>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Iterable<Tuple2<String, Row>> call(
                    Tuple2<Long, Row> tuple) throws Exception {
                Random random = new Random();
                List<Tuple2<String, Row>> list = new ArrayList<Tuple2<String, Row>>();
                for(int i = 0; i < 100; i++) {
                    list.add(new Tuple2<String, Row>(i + "_" + tuple._1, tuple._2));
                }
                return list;
            }

        });

// 將rdd1中分拆出來的致使傾斜的key的獨立rdd,每條數據都打上100之內的隨機前綴。
// 而後將這個rdd1中分拆出來的獨立rdd,與上面rdd2中分拆出來的獨立rdd,進行join。
JavaPairRDD<Long, Tuple2<String, Row>> joinedRDD1 = skewedRDD.mapToPair(
        new PairFunction<Tuple2<Long,String>, String, String>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Tuple2<String, String> call(Tuple2<Long, String> tuple)
                    throws Exception {
                Random random = new Random();
                int prefix = random.nextInt(100);
                return new Tuple2<String, String>(prefix + "_" + tuple._1, tuple._2);
            }
        })
        .join(skewedUserid2infoRDD)
        .mapToPair(new PairFunction<Tuple2<String,Tuple2<String,Row>>, Long, Tuple2<String, Row>>() {
                        private static final long serialVersionUID = 1L;
                        @Override
                        public Tuple2<Long, Tuple2<String, Row>> call(
                            Tuple2<String, Tuple2<String, Row>> tuple)
                            throws Exception {
                            long key = Long.valueOf(tuple._1.split("_")[1]);
                            return new Tuple2<Long, Tuple2<String, Row>>(key, tuple._2);
                        }
                    });

// 將rdd1中分拆出來的包含普通key的獨立rdd,直接與rdd2進行join。
JavaPairRDD<Long, Tuple2<String, Row>> joinedRDD2 = commonRDD.join(rdd2);

// 將傾斜key join後的結果與普通key join後的結果,uinon起來。
// 就是最終的join結果。
JavaPairRDD<Long, Tuple2<String, Row>> joinedRDD = joinedRDD1.union(joinedRDD2);

解決方案七:使用隨機前綴和擴容RDD進行join

方案適用場景:若是在進行join操做時,RDD中有大量的key致使數據傾斜,那麼進行分拆key也沒什麼意義,此時就只能使用最後一種方案來解決問題了。

方案實現思路:

  • 該方案的實現思路基本和「解決方案六」相似,首先查看RDD/Hive表中的數據分佈狀況,找到那個形成數據傾斜的RDD/Hive表,好比有多個key都對應了超過1萬條數據。
  • 而後將該RDD的每條數據都打上一個n之內的隨機前綴。
  • 同時對另一個正常的RDD進行擴容,將每條數據都擴容成n條數據,擴容出來的每條數據都依次打上一個0~n的前綴。
  • 最後將兩個處理後的RDD進行join便可。

方案實現原理:將原先同樣的key經過附加隨機前綴變成不同的key,而後就能夠將這些處理後的「不一樣key」分散到多個task中去處理,而不是讓一個task處理大量的相同key。該方案與「解決方案六」的不一樣之處就在於,上一種方案是儘可能只對少數傾斜key對應的數據進行特殊處理,因爲處理過程須要擴容RDD,所以上一種方案擴容RDD後對內存的佔用並不大;而這一種方案是針對有大量傾斜key的狀況,無法將部分key拆分出來進行單獨處理,所以只能對整個RDD進行數據擴容,對內存資源要求很高。

方案優勢:對join類型的數據傾斜基本均可以處理,並且效果也相對比較顯著,性能提高效果很是不錯。

方案缺點:該方案更多的是緩解數據傾斜,而不是完全避免數據傾斜。並且須要對整個RDD進行擴容,對內存資源要求很高。

方案實踐經驗:曾經開發一個數據需求的時候,發現一個join致使了數據傾斜。優化以前,做業的執行時間大約是60分鐘左右;使用該方案優化以後,執行時間縮短到10分鐘左右,性能提高了6倍。

// 首先將其中一個key分佈相對較爲均勻的RDD膨脹100倍。
JavaPairRDD<String, Row> expandedRDD = rdd1.flatMapToPair(
        new PairFlatMapFunction<Tuple2<Long,Row>, String, Row>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Iterable<Tuple2<String, Row>> call(Tuple2<Long, Row> tuple)
                    throws Exception {
                List<Tuple2<String, Row>> list = new ArrayList<Tuple2<String, Row>>();
                for(int i = 0; i < 100; i++) {
                    list.add(new Tuple2<String, Row>(0 + "_" + tuple._1, tuple._2));
                }
                return list;
            }
        });

// 其次,將另外一個有數據傾斜key的RDD,每條數據都打上100之內的隨機前綴。
JavaPairRDD<String, String> mappedRDD = rdd2.mapToPair(
        new PairFunction<Tuple2<Long,String>, String, String>() {
            private static final long serialVersionUID = 1L;
            @Override
            public Tuple2<String, String> call(Tuple2<Long, String> tuple)
                    throws Exception {
                Random random = new Random();
                int prefix = random.nextInt(100);
                return new Tuple2<String, String>(prefix + "_" + tuple._1, tuple._2);
            }
        });

// 將兩個處理後的RDD進行join便可。
JavaPairRDD<String, Tuple2<String, Row>> joinedRDD = mappedRDD.join(expandedRDD);

解決方案八:多種方案組合使用

在實踐中發現,不少狀況下,若是隻是處理較爲簡單的數據傾斜場景,那麼使用上述方案中的某一種基本就能夠解決。可是若是要處理一個較爲複雜的數據傾斜場景,那麼可能須要將多種方案組合起來使用。好比說,咱們針對出現了多個數據傾斜環節的Spark做業,能夠先運用解決方案一和二,預處理一部分數據,並過濾一部分數據來緩解;其次能夠對某些shuffle操做提高並行度,優化其性能;最後還能夠針對不一樣的聚合或join操做,選擇一種方案來優化其性能。你們須要對這些方案的思路和原理都透徹理解以後,在實踐中根據各類不一樣的狀況,靈活運用多種方案,來解決本身的數據傾斜問題。

shuffle調優

調優概述

大多數Spark做業的性能主要就是消耗在了shuffle環節,由於該環節包含了大量的磁盤IO、序列化、網絡數據傳輸等操做。所以,若是要讓做業的性能更上一層樓,就有必要對shuffle過程進行調優。可是也必須提醒你們的是,影響一個Spark做業性能的因素,主要仍是代碼開發、資源參數以及數據傾斜,shuffle調優只能在整個Spark的性能調優中佔到一小部分而已。所以你們務必把握住調優的基本原則,千萬不要捨本逐末。下面咱們就給你們詳細講解shuffle的原理,以及相關參數的說明,同時給出各個參數的調優建議。

ShuffleManager發展概述

在Spark的源碼中,負責shuffle過程的執行、計算和處理的組件主要就是ShuffleManager,也即shuffle管理器。而隨着Spark的版本的發展,ShuffleManager也在不斷迭代,變得愈來愈先進。

在Spark 1.2之前,默認的shuffle計算引擎是HashShuffleManager。該ShuffleManager而HashShuffleManager有着一個很是嚴重的弊端,就是會產生大量的中間磁盤文件,進而由大量的磁盤IO操做影響了性能。

所以在Spark 1.2之後的版本中,默認的ShuffleManager改爲了SortShuffleManager。SortShuffleManager相較於HashShuffleManager來講,有了必定的改進。主要就在於,每一個Task在進行shuffle操做時,雖然也會產生較多的臨時磁盤文件,可是最後會將全部的臨時文件合併(merge)成一個磁盤文件,所以每一個Task就只有一個磁盤文件。在下一個stage的shuffle read task拉取本身的數據時,只要根據索引讀取每一個磁盤文件中的部分數據便可。

下面咱們詳細分析一下HashShuffleManager和SortShuffleManager的原理。

HashShuffleManager運行原理

未經優化的HashShuffleManager

下圖說明了未經優化的HashShuffleManager的原理。這裏咱們先明確一個假設前提:每一個Executor只有1個CPU core,也就是說,不管這個Executor上分配多少個task線程,同一時間都只能執行一個task線程。

咱們先從shuffle write開始提及。shuffle write階段,主要就是在一個stage結束計算以後,爲了下一個stage能夠執行shuffle類的算子(好比reduceByKey),而將每一個task處理的數據按key進行「分類」。所謂「分類」,就是對相同的key執行hash算法,從而將相同key都寫入同一個磁盤文件中,而每個磁盤文件都只屬於下游stage的一個task。在將數據寫入磁盤以前,會先將數據寫入內存緩衝中,當內存緩衝填滿以後,纔會溢寫到磁盤文件中去。

那麼每一個執行shuffle write的task,要爲下一個stage建立多少個磁盤文件呢?很簡單,下一個stage的task有多少個,當前stage的每一個task就要建立多少份磁盤文件。好比下一個stage總共有100個task,那麼當前stage的每一個task都要建立100份磁盤文件。若是當前stage有50個task,總共有10個Executor,每一個Executor執行5個Task,那麼每一個Executor上總共就要建立500個磁盤文件,全部Executor上會建立5000個磁盤文件。因而可知,未經優化的shuffle write操做所產生的磁盤文件的數量是極其驚人的。

接着咱們來講說shuffle read。shuffle read,一般就是一個stage剛開始時要作的事情。此時該stage的每個task就須要將上一個stage的計算結果中的全部相同key,從各個節點上經過網絡都拉取到本身所在的節點上,而後進行key的聚合或鏈接等操做。因爲shuffle write的過程當中,task給下游stage的每一個task都建立了一個磁盤文件,所以shuffle read的過程當中,每一個task只要從上游stage的全部task所在節點上,拉取屬於本身的那一個磁盤文件便可。

shuffle read的拉取過程是一邊拉取一邊進行聚合的。每一個shuffle read task都會有一個本身的buffer緩衝,每次都只能拉取與buffer緩衝相同大小的數據,而後經過內存中的一個Map進行聚合等操做。聚合完一批數據後,再拉取下一批數據,並放到buffer緩衝中進行聚合操做。以此類推,直到最後將全部數據到拉取完,並獲得最終的結果。

優化後的HashShuffleManager

下圖說明了優化後的HashShuffleManager的原理。這裏說的優化,是指咱們能夠設置一個參數,spark.shuffle.consolidateFiles。該參數默認值爲false,將其設置爲true便可開啓優化機制。一般來講,若是咱們使用HashShuffleManager,那麼都建議開啓這個選項。

開啓consolidate機制以後,在shuffle write過程當中,task就不是爲下游stage的每一個task建立一個磁盤文件了。此時會出現shuffleFileGroup的概念,每一個shuffleFileGroup會對應一批磁盤文件,磁盤文件的數量與下游stage的task數量是相同的。一個Executor上有多少個CPU core,就能夠並行執行多少個task。而第一批並行執行的每一個task都會建立一個shuffleFileGroup,並將數據寫入對應的磁盤文件內。

當Executor的CPU core執行完一批task,接着執行下一批task時,下一批task就會複用以前已有的shuffleFileGroup,包括其中的磁盤文件。也就是說,此時task會將數據寫入已有的磁盤文件中,而不會寫入新的磁盤文件中。所以,consolidate機制容許不一樣的task複用同一批磁盤文件,這樣就能夠有效將多個task的磁盤文件進行必定程度上的合併,從而大幅度減小磁盤文件的數量,進而提高shuffle write的性能。

假設第二個stage有100個task,第一個stage有50個task,總共仍是有10個Executor,每一個Executor執行5個task。那麼本來使用未經優化的HashShuffleManager時,每一個Executor會產生500個磁盤文件,全部Executor會產生5000個磁盤文件的。可是此時通過優化以後,每一個Executor建立的磁盤文件的數量的計算公式爲:CPU core的數量 * 下一個stage的task數量。也就是說,每一個Executor此時只會建立100個磁盤文件,全部Executor只會建立1000個磁盤文件。

SortShuffleManager運行原理

SortShuffleManager的運行機制主要分紅兩種,一種是普通運行機制,另外一種是bypass運行機制。當shuffle read task的數量小於等於spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold參數的值時(默認爲200),就會啓用bypass機制。

普通運行機制

下圖說明了普通的SortShuffleManager的原理。在該模式下,數據會先寫入一個內存數據結構中,此時根據不一樣的shuffle算子,可能選用不一樣的數據結構。若是是reduceByKey這種聚合類的shuffle算子,那麼會選用Map數據結構,一邊經過Map進行聚合,一邊寫入內存;若是是join這種普通的shuffle算子,那麼會選用Array數據結構,直接寫入內存。接着,每寫一條數據進入內存數據結構以後,就會判斷一下,是否達到了某個臨界閾值。若是達到臨界閾值的話,那麼就會嘗試將內存數據結構中的數據溢寫到磁盤,而後清空內存數據結構。

在溢寫到磁盤文件以前,會先根據key對內存數據結構中已有的數據進行排序。排序事後,會分批將數據寫入磁盤文件。默認的batch數量是10000條,也就是說,排序好的數據,會以每批1萬條數據的形式分批寫入磁盤文件。寫入磁盤文件是經過Java的BufferedOutputStream實現的。BufferedOutputStream是Java的緩衝輸出流,首先會將數據緩衝在內存中,當內存緩衝滿溢以後再一次寫入磁盤文件中,這樣能夠減小磁盤IO次數,提高性能。

一個task將全部數據寫入內存數據結構的過程當中,會發生屢次磁盤溢寫操做,也就會產生多個臨時文件。最後會將以前全部的臨時磁盤文件都進行合併,這就是merge過程,此時會將以前全部臨時磁盤文件中的數據讀取出來,而後依次寫入最終的磁盤文件之中。此外,因爲一個task就只對應一個磁盤文件,也就意味着該task爲下游stage的task準備的數據都在這一個文件中,所以還會單獨寫一份索引文件,其中標識了下游各個task的數據在文件中的start offset與end offset。

SortShuffleManager因爲有一個磁盤文件merge的過程,所以大大減小了文件數量。好比第一個stage有50個task,總共有10個Executor,每一個Executor執行5個task,而第二個stage有100個task。因爲每一個task最終只有一個磁盤文件,所以此時每一個Executor上只有5個磁盤文件,全部Executor只有50個磁盤文件。

bypass運行機制

下圖說明了bypass SortShuffleManager的原理。bypass運行機制的觸發條件以下:

  • shuffle map task數量小於spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold參數的值。
  • 不是聚合類的shuffle算子(好比reduceByKey)。

此時task會爲每一個下游task都建立一個臨時磁盤文件,並將數據按key進行hash而後根據key的hash值,將key寫入對應的磁盤文件之中。固然,寫入磁盤文件時也是先寫入內存緩衝,緩衝寫滿以後再溢寫到磁盤文件的。最後,一樣會將全部臨時磁盤文件都合併成一個磁盤文件,並建立一個單獨的索引文件。

該過程的磁盤寫機制其實跟未經優化的HashShuffleManager是如出一轍的,由於都要建立數量驚人的磁盤文件,只是在最後會作一個磁盤文件的合併而已。所以少許的最終磁盤文件,也讓該機制相對未經優化的HashShuffleManager來講,shuffle read的性能會更好。

而該機制與普通SortShuffleManager運行機制的不一樣在於:第一,磁盤寫機制不一樣;第二,不會進行排序。也就是說,啓用該機制的最大好處在於,shuffle write過程當中,不須要進行數據的排序操做,也就節省掉了這部分的性能開銷。

shuffle相關參數調優

如下是Shffule過程當中的一些主要參數,這裏詳細講解了各個參數的功能、默認值以及基於實踐經驗給出的調優建議。

spark.shuffle.file.buffer

  • 默認值:32k
  • 參數說明:該參數用於設置shuffle write task的BufferedOutputStream的buffer緩衝大小。將數據寫到磁盤文件以前,會先寫入buffer緩衝中,待緩衝寫滿以後,纔會溢寫到磁盤。
  • 調優建議:若是做業可用的內存資源較爲充足的話,能夠適當增長這個參數的大小(好比64k),從而減小shuffle write過程當中溢寫磁盤文件的次數,也就能夠減小磁盤IO次數,進而提高性能。在實踐中發現,合理調節該參數,性能會有1%~5%的提高。

spark.reducer.maxSizeInFlight

  • 默認值:48m
  • 參數說明:該參數用於設置shuffle read task的buffer緩衝大小,而這個buffer緩衝決定了每次可以拉取多少數據。
  • 調優建議:若是做業可用的內存資源較爲充足的話,能夠適當增長這個參數的大小(好比96m),從而減小拉取數據的次數,也就能夠減小網絡傳輸的次數,進而提高性能。在實踐中發現,合理調節該參數,性能會有1%~5%的提高。

spark.shuffle.io.maxRetries

  • 默認值:3
  • 參數說明:shuffle read task從shuffle write task所在節點拉取屬於本身的數據時,若是由於網絡異常致使拉取失敗,是會自動進行重試的。該參數就表明了能夠重試的最大次數。若是在指定次數以內拉取仍是沒有成功,就可能會致使做業執行失敗。
  • 調優建議:對於那些包含了特別耗時的shuffle操做的做業,建議增長重試最大次數(好比60次),以免因爲JVM的full gc或者網絡不穩定等因素致使的數據拉取失敗。在實踐中發現,對於針對超大數據量(數十億~上百億)的shuffle過程,調節該參數能夠大幅度提高穩定性。

spark.shuffle.io.retryWait

  • 默認值:5s
  • 參數說明:具體解釋同上,該參數表明了每次重試拉取數據的等待間隔,默認是5s。
  • 調優建議:建議加大間隔時長(好比60s),以增長shuffle操做的穩定性。

spark.shuffle.memoryFraction

  • 默認值:0.2
  • 參數說明:該參數表明了Executor內存中,分配給shuffle read task進行聚合操做的內存比例,默認是20%。
  • 調優建議:在資源參數調優中講解過這個參數。若是內存充足,並且不多使用持久化操做,建議調高這個比例,給shuffle read的聚合操做更多內存,以免因爲內存不足致使聚合過程當中頻繁讀寫磁盤。在實踐中發現,合理調節該參數能夠將性能提高10%左右。

spark.shuffle.manager

  • 默認值:sort
  • 參數說明:該參數用於設置ShuffleManager的類型。Spark 1.5之後,有三個可選項:hash、sort和tungsten-sort。HashShuffleManager是Spark 1.2之前的默認選項,可是Spark 1.2以及以後的版本默認都是SortShuffleManager了。tungsten-sort與sort相似,可是使用了tungsten計劃中的堆外內存管理機制,內存使用效率更高。
  • 調優建議:因爲SortShuffleManager默認會對數據進行排序,所以若是你的業務邏輯中須要該排序機制的話,則使用默認的SortShuffleManager就能夠;而若是你的業務邏輯不須要對數據進行排序,那麼建議參考後面的幾個參數調優,經過bypass機制或優化的HashShuffleManager來避免排序操做,同時提供較好的磁盤讀寫性能。這裏要注意的是,tungsten-sort要慎用,由於以前發現了一些相應的bug。

spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold

  • 默認值:200
  • 參數說明:當ShuffleManager爲SortShuffleManager時,若是shuffle read task的數量小於這個閾值(默認是200),則shuffle write過程當中不會進行排序操做,而是直接按照未經優化的HashShuffleManager的方式去寫數據,可是最後會將每一個task產生的全部臨時磁盤文件都合併成一個文件,並會建立單獨的索引文件。
  • 調優建議:當你使用SortShuffleManager時,若是的確不須要排序操做,那麼建議將這個參數調大一些,大於shuffle read task的數量。那麼此時就會自動啓用bypass機制,map-side就不會進行排序了,減小了排序的性能開銷。可是這種方式下,依然會產生大量的磁盤文件,所以shuffle write性能有待提升。

spark.shuffle.consolidateFiles

    • 默認值:false
    • 參數說明:若是使用HashShuffleManager,該參數有效。若是設置爲true,那麼就會開啓consolidate機制,會大幅度合併shuffle write的輸出文件,對於shuffle read task數量特別多的狀況下,這種方法能夠極大地減小磁盤IO開銷,提高性能。
    • 調優建議:若是的確不須要SortShuffleManager的排序機制,那麼除了使用bypass機制,還能夠嘗試將spark.shffle.manager參數手動指定爲hash,使用HashShuffleManager,同時開啓consolidate機制。在實踐中嘗試過,發現其性能比開啓了bypass機制的SortShuffleManager要高出10%~30%。

 

轉載自https://tech.meituan.com/spark-tuning-pro.html

相關文章
相關標籤/搜索