生信——快速將樣本的名字寫到sample.list中

生信分析中，不少時候須要用到sample.list, 基本上這個就是實現多樣本並行的不可缺乏的文件。那若是有幾百個樣本的fastq.gz文件，如何將快速列出一個sample.list呢？用下面這句話就能夠了

ls -1 | grep "_L001_R1_001.fastq.gz$"|sed 's/_L001_R1_001.fastq.gz//g' >sample.list

 

剛下機的原始數據：

CM10-1_S10_L001_R1_001.fastq.gz
CM10-1_S10_L001_R2_001.fastq.gz

sample.list:

CM10-1_S10