常見變異影響常見疾病,罕見變異影響罕見疾病?

通常來講,常見變異影響常見疾病,罕見變異影響罕見疾病。blog

常見疾病/表型(好比糖尿病、身高),通常都是由許多微效做用位點共同影響的。get

罕見疾病(好比家族性乳糜微粒血癥綜合徵),通常由一個或幾個效應值極強的罕見變異影響。coding

好比下面這個圖,就很好的說明了這個問題。gc

Eoyr8A.md.png

可是,世界不是非黑即白,凡事都有個例外。科研也是如此。im

1 罕見變異影響罕見疾病案例

SETD1A上的一個缺失變異致使閱讀障礙症;d3

成纖維細胞生長因子受體-3(FGFR3)的點突變致使軟骨發育不全;統計

2 罕見變異影響常見疾病案例

TREM2基因上的rs75932628(位點突變頻率0.0063 )影響阿爾茲海默病;db

GHR上的rs121909358(位點突變頻率0.0087 ) 影響身高;img

APOC3上的rs138326449(頻率0.001)影響甘油三酯;di

3 常見變異影響常見疾病案例

ARSA基因上的rs2071421(頻率爲0.47)影響二型糖尿病;

SORT1基因上的rs599839(頻率爲0.3127)影響低密度脂蛋白;

4 常見變異影響罕見疾病案例

EXOC4基因上的rs12538505(頻率爲0.485)影響孤獨症;

後記:

最近常常看到許多反常規的研究結果,好比有不少罕見變異位點影響身高,並且效應值極大;還有不少常見變異影響罕見的神經發育障礙疾病的嚴重程度。

感興趣的請搜「Rare and low-frequency coding variants alter human adult height」和「Common genetic variants contribute to risk of rare severe neurodevelopmental disorders」這兩篇比較經典的文獻。

我相信,將來,隨着統計學power不斷提高,會有更多的這種反常規的結果出如今咱們面前。

也側面說明了若是GWAS研究結果不理想,能夠考慮用罕見變異去尋找可能的結果。

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