自己動手計算TSS Enrichment score

歡迎關注」生信修煉手冊」! Encode將TSS Enrichment score作爲ATAC文庫質控的一個指標，不同的參考基因組註釋文件，對應的閾值也不同，示意如下 所謂TSS Enrichment score, 其實是所有基因TSS位點測序深度的平均值。要計算這個值，需要兩個文件，一個是bam文件，保存了測序深度信息，另外一個是參考基因組TSS位點文件，可以從gtf文件中提取得到，記錄了TSS

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