R鏡像源的切換

若是是默認的R安裝通常會很慢

install.packages(pkgs, lib, repos = getOption("repos"),
contriburl = contrib.url(repos, type),
method, available = NULL, destdir = NULL,
dependencies = NA, type = getOption("pkgType"),
configure.args = getOption("configure.args"),
configure.vars = getOption("configure.vars"),
clean = FALSE, Ncpus = getOption("Ncpus", 1L),
verbose = getOption("verbose"),
libs_only = FALSE, INSTALL_opts, quiet = FALSE,
keep_outputs = FALSE, ...)
install.packages("ABC",repos="http://mirror.bjtu.edu.cn/ "),換成北大的鏡像或者清華鏡像應該都會很快
若是想永久設置，就用options修改便可。

bioconductor其實也是有鏡像的

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
biocLite("RGalaxy")##這樣就用中科大的鏡像來下載包啦
## bioconductor還有不少其它鏡像：https://www.bioconductor.org/about/mirrors/
##https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/utils/html/chooseBioCmirror.html
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))

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1.調用chooseCRANmirror函數：
> chooseCRANmirror()
R會顯示CRAN鏡像的列表。
2.從列表中選擇鏡像並點擊肯定。
3.經過查看repos選項的第一個元素來獲取所選鏡像的URL地址：
> options("repos")[[1]][1]
4.將下面的命令添加至.Rprofile 文件中：
options(repos="URL")
其中的URL就是鏡像的URL。
討論
在每次安裝R包的過程當中都會使用相同的CRAN鏡像（即離本地最近的鏡像地址）。你可能對於R重複地詢問選擇鏡像感到厭煩。按照上述方法所給出的解決方案進行操做，便設定了默認的鏡像，R每次就再也不詢問了。
repos選項是默認鏡像的名稱。使用chooseCRANmirror函數選擇鏡像時會有一個重要的反作用，即按照選擇來設定repos選項。問題是當R退出時，R不會保存選擇的鏡像爲默認鏡像。經過在.Rprofile中對repos進行設定，R在啓動時會自動恢復你的設定。