haploview繪製曼哈頓圖

歡迎關注"生信修煉手冊"！ 對於GWAS分析的結果，最常見的可視化手段就是曼哈頓圖了。一個典型的曼哈頓圖示例如下 圖中的每個點代表一個SNP位點，橫座標是SNP位點在染色體上的位置，縱座標是關聯分析計算出的p值。爲了美觀，不同染色體上的SNP位點用不同顏色標識。縱軸上的虛線代表閾值，p值越小，對應到縱軸的值越大。通常在閾值上方的SNP位點認爲是和疾病或者形狀相關聯的位點。 曼哈頓圖本質上就是一個散

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