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kraken軟件操做手冊
時間 2019-12-06
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轉錄組數據質量分析完,想拿kraken軟件分析下數據有沒有微生物的序列污染html 找了全網沒看見什麼相關的指導文章,看官網的操做手冊也很雞助,因此本身翻譯了官網手冊以及寫了代碼,但願對後來的人有些幫助。數據庫 Kraken是2013年Wood提出的的宏基因組序列分類軟件,可以快速對宏基因樣品中的DNA序列進行分類,所以能夠進行微生物檢測。Kraken在序列比對環節(環節C)採用精確k-mer匹配
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