MINC2.0 在windows上的使用

　　前幾天一直糾結如何用VS2005，ITK3.0.0讀取mnc格式的圖片.因爲早期版本的ITK沒有mnc格式圖片的接口，所以使用了http://www.insight-journal.org/browse/publication/88下載的讀取mnc格式圖片的程序，以後開始了漫長的安裝道路。如今來總結一下。

　　MINC是Medical Imaging NetCDF的縮寫，最開始是NetCDF文件格式的一個特例，以後因爲MINC1的格式存在大小、存儲限制，所以進化成了MINC2，這個格式須要一個新的文件格式庫來支持，就是HDF5.具體的內容能夠參考MINC 2.0 Programmer's Reference Manual.所以使用MINC2.0首先要安裝幾個庫，hdf五、minc、netCDF、szip和zlib。

　　安裝過程是基於VS2005和win7系統的。

　　（1）下載庫，我用的版本分別是hdf5-1.8.4，minc2.0，netCDF-3.5.0，szip-2.1，zlib-1.2.3。

　　hdf5-1.8.4：http://www.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.8.4-patch1/obtain5184p1.html

　　minc2.0：http://packages.bic.mni.mcgill.ca/win32/minc-2.0.15_SEP04_08.exe；http://packages.bic.mni.mcgill.ca/win32/minc-2.0.11.exe

　　netCDF-3.5.0：http://www.gfd-dennou.org/arch/ucar/netcdf/contrib/win32/

　　szip-2.1：http://www.hdfgroup.org/ftp/HDF5/prev-releases/hdf5-1.8.4-patch1/bin/win32-vs2005/

　　zlib-1.2.3：http://code.google.com/p/google-desktop-for-linux-mirror/downloads/detail?name=zlib-1.2.3.tar.gz&can=2&q=

　　（2）安裝各個庫，下載的基本是已經編譯好的文件，因此能夠直接將.h文件和.lib文件包含到VS2005 options中的C++ directories中便可。

　　（3）新建項目，將最開始下得MINC2的IO文件以及Test文件加入工程中，以後，在項目的properties->Linker->Input->Additional Dependencies中添加全部的庫文件：itkgdcm.lib minc2.lib szlibdll.lib volume_io2.lib hdf5dll.lib ITKAlgorithms.lib ITKBasicFilters.lib ITKCommon.lib MSVCRTD.lib LIBCMT.lib ITKDICOMParser.lib ITKEXPAT.lib ITKFEM.lib ITKIO.lib itkjpeg8.lib itkjpeg12.lib itkjpeg16.lib ITKMetaIO.lib ITKniftiio.lib ITKNrrdIO.lib ITKNumerics.lib itkopenjpeg.lib itkpng.lib ITKSpatialObject.lib ITKStatistics.lib itksys.lib itkTestDriver.lib itktestlib.lib itktiff.lib itkv3p_netlib.lib itkvcl.lib itkvnl.lib itkvnl_algo.lib itkvnl_inst.lib itkzlib.lib ITKznz.lib netcdf.lib libszip.lib hdf5.lib hdf5_cpp.lib hdf5_f90cstub.lib hdf5_fortran.lib hdf5_hl.lib hdf5_hl_cpp.lib hdf5_hl_f90cstub.lib hdf5_hl_fortran.lib snmpapi.lib rpcrt4.lib wsock32.lib zdll.lib zlib.lib

　　（4）編譯運行便可。運行時能夠使用命令行調用，參數只須要輸入輸入圖等，具體的能夠參考程序。程序中有一些動態數組定義的問題，能夠參考源網站中的評論，有修改的幫助。