python_字符串_經常使用處理

1. 輸出原序列的反向互補序列

in1 = open("brca1.fasta", "r")
out1 = open("re_brca1.fasta", "w")

raw = in1.readlines()
# 序列信息暫時不想改
out1.write(raw[0])
s = raw[1].split("\n")[0]
# 原序列中存在小寫，先統一改成大寫
s = s.upper()
# 不指定替換次數，因此所有替換
s.replace('G', 'C')
s.replace('C', 'G')
s.replace('A', 'T')
s.replace('T', 'A')
# 逆序輸出，再加個換行符：）
out1.write(s[::-1]+"\n")

out1.close()
in1.close()

 2. 讀取大量數據：試了2millions行的文件,ok

with open('probes.blast.txt') as file:
    for line in file: