Coding and Paper Letter(二十九)

資源整理,國慶套餐有點豐厚,分開兩篇,老規矩,一篇Coding,一篇論文。html

Coding:

1.R語言包dbplyr,用於數據庫接口的dplyr。python

dbplyrgit

2.世界的topojson數據集,包含有一些國家的數據。github

topojsonweb

3.LearnGitBranching是一個git存儲庫可視化工具,沙箱,以及一系列教程和挑戰。docker

learnGitBranching數據庫

4.交互式的統計繪圖,應當是基於Python的bokeh包。編程

my bokeh plotsjson

5.書"Introducing Probability & Decision with a Visual Emphasis"的附錄代碼。api

vip source

6.FSH556的課程材料:2018年春季在威斯康星大學課程:爲生態學家設計的時空模型。

2018_FSH556

7.單變量或多變量數據的時空分析,例如,標準化多個物種或階段的數據。

VAST

8.R包fastGHQuad,快速,數值穩定的Gauss-Hermite積分求取。

fastGHQuad

9.R語言包DatabaseConnector,使用JDBC鏈接數據庫的R包。

DatabaseConnector

10.R語言包spatstat.utils,spatstat包正在被拆分爲子包。 這些子包中的第一個是spatstat.utils。

spatstat.utils

11.R語言包cosinor2,用於旋律的餘弦分析拓展工具。

cosinor2

12.開源的svg小圖標,託管在Gitlab上的鏡像。

osmic

13.R語言包SpatPCA,空間數據的正則化主成分分析。

SpatPCA

14.使用WebGL進行海底渲染。

undersea

15.R語言包bookdownThemeEditor,在Rstudio更方便地自定義bookdown和gitbook的書風格。

bookdownThemeEditor

16.R語言包pagedown,使用CSS打印用於分割R Markdown的HTML輸出。

pagedown

17.R語言包multispeciesPP,多物種存在缺失和僅存在數據的泊松過程模型。

multispeciesPP

18.以Metropolis爲主題的RMarkdown驅動的LaTeX Beamer演示示例。

samples rmarkdown metropolis

19.Rcpp的簡單NLopt用法示例。

rcppnloptexample

20.神經網絡硬件加速器的編譯器。

glow

21.此代碼從新實現了原始的Comparing Continous Optimizer平臺,如今用ANSI C和Python徹底重寫,其餘語言調用C代碼。 顧名思義,該代碼提供了一個平臺來對基準和比較連續優化器,AKA非線性求解器進行數值優化。

coco

22.R語言包roadworksUK,roadworksUK的目標是使您可以訪問,處理和可視化英國道路工程中的數據。

roadworksUK

23.R語言包pmap,R中的流程圖可視化。

pmap

24.這是一個用於在貝葉斯分層迴歸框架中對零膨脹計數數據進行建模的軟件包。 該軟件包將統一許多基本的零膨脹和障礙模型,如ZIP和ZINB,但該軟件包的主要獨特功能是執行雙障礙模型的功能,用於適應同時爲零的數據。

hurdlr

25.來自UBC MDS計劃的一些教學材料的公開可用版本。

public

26.R語言包esquisse,RStudio的add-in用於ggplot2製做圖。

esquisse

27.R語言包viewxl,RStudio的add-in用於Excel中打開data.frame。

viewxl

28.R和MATLAB中的大規模貝葉斯變量選擇。

varbvs

29.即將出版的rmarkdown書籍。

rmarkdown book

30.docker容器gds env,其中包括:完整的Python堆棧可用於地理空間分析(有關詳細列表,請參閱gda_stack.yml)。完整的R堆棧可用於地理空間分析(有關詳細列表,請參閱install.R)。IRkernel和rpy2通道都經過Python與R交互。完整的LaTeX發行版。其餘開發實用程序(例如pandoc,git,decktape等)。它至關大(大約10GB),但它旨在提供一個徹底隔離的環境,能夠在各類環境中部署。

gds env

31.地理數據科學17。地理數據科學17課程的材料和網站,由利物浦大學的Dani Arribas-Bel教授。 該課程對去年的本科生和碩士生開放。

gds17

32.R語言包crosstalk,R的inter-htmlwidget鏈接(有和沒有Shiny)。

crosstalk

33.一個Rstudio add-in,用於在Rmarkdown文檔中將非代碼塊文本區域強行放置到邊距/寬度爲80。

reflowdoc

34.R語言包salty,在教學生如何清理數據時,有助於得到不太乾淨的數據。 salty提供了清潔數據的功能,這些數據一般存在於野外數據集中

salty

35.R語言包gmailr,Gmail的REST API的R接口。

gmailr

36.PPUA 7237:東北大學先進的空間分析課程。

ppua7237

37.空間數據科學課程的R教程。

lab tutorials

38.一系列的Docker鏡像(以及他們的衍生),容許你快速搭建起你的深度學習環境。

deepo

39.R語言包customLayout,從R簡單擴展基本佈局功能。

customLayout

40.研究Joseph O'Rourke的「C語言中的計算機圖形學」(第2版)。

ComputationGeometry

41.R語言nanotime,R的納秒分辨率時間函數。

nanotime

42.開源的鄰域分析程序。

osnap

43.空間分析網站的源碼。

spatialanalysis.github.io

44.R語言包gridgraphics,使用網格圖形重繪基本圖形。

gridgraphics

45.R的MetaPost接口。

metapost

46.R語言包dvir,用於讀取和渲染dvi文件。

dvir

47.利用貝葉斯模型平均法檢測加納北部殘留瘧疾的局部風險因素。

bma malaria

48.公共API資源。

public apis

49.美國伯克利地區交通模型網頁。

modeling website

50.基於因子圖的MCMC抽樣器。

pedfac

51.R語言包mgcFam,提供額外系列分佈的R包,可在mgcv中使用。

mgcFam

52.在GeostatsGuy Lectures Channel上的YouTube上提供了地統計學概論。

LectureExercises

53.這是Dockerfiles的存儲庫,爲Earth Lab項目提供開箱即用的功能。適用於雲計算的地球科學的Docker化的R和Python環境。

dockerfiles

54.環境方面的代碼共享開發組。

Environmental Code Sharing

55.TLS / SSL和加密庫openssl。

openssl

56.R語言包xaringan,謝益輝大大開發的R包,中文譯名寫輪眼,專門用於製做幻燈片。

xaringan

57.適用於Digital Globe GBDX的簡單CLI。

pygbdx

58.R語言包SubdirSrc,R包顯示如何經過修改Makevars文件在src /文件夾中的子目錄中嵌入代碼。

rcpp headers subdirs

59.R語言包mplib,Mplib的R接口。

mplib

60.R語言包crocodile,切片和從新排列圖片。

crocodile

61.Python的各類資源。

awesome python

62.R語言包tinkr,將(R)Markdown文件轉換爲XML,編輯它們,將它們寫回(R)Markdown。

tinkr

63.R語言包cliapp,富命令行應用。可使用如顏色等效果。

cliapp

64.R語言包clustermq,R包將函數調用做爲LSF,SGE,Slurm,PBS / Torque上的做業發送,或者經過SSH發送。

clustermq

65.Python庫pyxel,Python的復古遊戲引擎。

pyxel

66.開源項目snake,基於pyxel開發的貪吃蛇遊戲。

snake

67.使用Unet或Mask RCNN進行衛星圖像分割的代碼,並比較這兩種方法。

segmentation unet maskrcnn

68.R語言包ComplexHeatmap,製做複雜的熱圖以及自定義註釋圖形。

ComplexHeatmap

69.R語言包hydrostats,根據每日流量數據計算水文指數。

hydrostats

70.Python庫fab-addon-geoalchemy。它會自動將POINT Geometry列轉換爲具備緯度和經度字段以及傳單地圖的小部件。 地圖有一個指向該位置的指針,而且有兩種方式綁定,其中拖動指針會改變輸入字段中的值,反之亦然。

fab addon geoalchemy

71.R語言包purrr,R的函數式編程工具包。

purrr

72.R語言包mobsim,依賴尺度的生物多樣性變化的空間分析。

mobsim

73.R語言包tsbox,R生態系統有着大量的時間序列標準。 tsbox提供了一組與現有標準無關的工具,而不是建立最終的第15個時間序列類。 這些工具還容許您將時間序列做爲純數據幀處理,從而能夠輕鬆處理dplyr或data.table工做流中的時間序列。

tsbox

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