R-loop數據分析之R-ChIP(樣本間BAM比較和可視化)

樣本間相關性評估 上一步得到各個樣本的BAM文件之後,就可以在全基因組範圍上看看這幾個樣本之間是否有差異。也就是先將基因組分成N個區間,然後用統計每個區間上比對上的read數。 腳本scripts/07.genome_bin_read_coverage.sh如下 #!/bin/bash set -e set -u set -o pipefail samples=${1?missing samp
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