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使用QTLseqr進行BSA-seq分析
時間 2020-05-15
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使用
qtlseqr
進行
bsa
seq
分析
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QTLseqr是一個用於BSA-seq的R包,它可以讀取GATK輸出結果進行過濾,最終使用SNP-index和G 統計值的方法進行定位。咱們此次嘗試使用這個R包來替代咱們本身手擼代碼來分析一批水稻BSA數據,文章的數據在如何使用BSA方法進行遺傳定位(水稻篇)提供了下載連接。git 首先是安裝和加載R包,因爲QTLseqr目前託管在GitHub上,所以須要用devtools才能安裝。github
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