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一文搞懂TCGA中的分析結果如何來
時間 2021-01-14
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歡迎關注」生信修煉手冊」! TCGA對於不同類型的數據,有着獨特的處理流程,具體如下 1. DNA-Seq Analysis Pipeline TCGA中的DNA測序主要用來分析腫瘤患者中的體細胞突變,和GATK的體細胞突變流程類似,前期都經過了一個預處理步驟,這裏稱之爲co-cleanning, 流程示意如下 就是經典的sort->markduplicate->Realign->BQSR步驟,得
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