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ChIP-Atlas:基於公共chip_seq數據進行分析挖掘
時間 2021-01-21
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歡迎關注」生信修煉手冊」! ChIP-Atlas收集整理了SRA數據庫中的大量chip_seq數據,並基於這些原始數據進行了後續分析,將分析結果整理成在線服務併發布,方便檢索與查詢,網址如下 https://chip-atlas.org/ 構建的流程如下 下載SRA原始數據,採用sratoolkit轉換成fastq, 然後用bowtie2比對參考基因組,用macs2進行peak calling。官
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