從應用到內核查接口超時(中)

應用復現


接着上文 從應用到內核查接口超時(上) 繼續排查致使接口超時的緣由。html

轉載隨意,文章會持續修訂,請註明來源地址:https://zhenbianshu.github.io 。java

Jdk 的 native 方法固然不是終點,雖然發現 Jdk、docker、操做系統 Bug 的可能性極小,但再往底層查卻極可能發現一些常見的配置錯誤。linux

爲了便於復現,我用 JMH 寫了一個簡單的 demo,控制速度不斷地經過 log4j2 寫入日誌。將項目打包成 jar 包,就能夠很方便地在各處運行了。git

@BenchmarkMode(Mode.AverageTime) @OutputTimeUnit(TimeUnit.MICROSECONDS) @State(Scope.Benchmark) @Threads(5) public class LoggerRunner { public static void main(String[] args) throws RunnerException { Options options = new OptionsBuilder() .include(LoggerRunner.class.getName()) .warmupIterations(2) .forks(1) .measurementIterations(1000) .build(); new Runner(options).run(); } } 

我比較懷疑是 docker 的緣由。可是在 docker 內外運行了 jar 包卻發現都能很簡單地復現日誌停頓問題。而 jdk 版本衆多,我準備首先排查操做系統配置問題。程序員

系統調用


strace 命令很早就使用過,不久前還用它分析過 shell 腳本執行慢的問題( 解決問題,別擴展問題),但我仍是不太習慣把 Java 和它聯繫起來,幸虧有部門的老司機指點,因而就使用 strace 分析了一波 Java 應用。github

命令跟分析普通腳本同樣, strace -T -ttt -f -o strace.log java -jar log.jar, -T 選項能夠將每個系統調用的耗時打印到系統調用的結尾。固然排查時使用 -p pid 附加到 tomcat 上也是能夠的,雖然會有不少容易混淆的系統調用。docker

對比 jmh 壓測用例輸出的 log4j2.info() 方法耗時,發現了下圖中的情況。shell

一次 write 系統調用居然消耗了 147ms,很明顯地,問題出在 write 系統調用上。api

文件系統


結構

這時候就要好好回想一下操做系統的知識了。tomcat

在 linux 系統中,萬物皆文件,而爲了給不一樣的介質提供一種抽象的接口,在應用層和系統層之間,抽象了一個虛擬文件系統層(virtual file system, VFS)。上層的應用程序經過 系統調用 system call 操做虛擬文件系統,進而反饋到下層的硬件層。

因爲硬盤等介質操做速度與內存不在同一個數量級上,爲了平衡二者之間的速度,linux 便把文件映射到內存中,將硬盤單位塊(block)對應到內存中的一個 頁(page)上。這樣,當須要操做文件時,直接操做內存就能夠了。當緩衝區操做達到必定量或到達必定的時間後,再將變動統一刷到磁盤上。這樣便有效地減小了磁盤操做,應用也沒必要等待硬盤操做結束,響應速度獲得了提高。

而 write 系統調用會將數據寫到內存中的 page cache,將 page 標記爲 髒頁(dirty) 後返回。

linux 的 writeback 機制

對於將內存緩衝區的內容刷到磁盤上,則有兩種方式:

首先,應用程序在調用 write 系統調用寫入數據時,若是發現 page cache 的使用量大於了設定的大小,便會主動將內存中的髒頁刷到硬盤上。在此期間,全部的 write 系統調用都會被阻塞。

系統固然不會容忍不定時的 write 阻塞,linux 還會定時啓動 pdflush 線程,判斷內存頁達到必定的比例或髒頁存活時間達到設定的時間,將這些髒頁刷回到磁盤上,以免被動刷緩衝區,這種機制就是 linux 的 writeback 機制。

猜想

瞭解了以上基礎知識,那麼對於 write 系統調用爲何會被阻塞,提出了兩種可能:

  • page cache 可用空間不足,致使觸發了主動的 flush,此時會阻塞全部對此 device 的 write。
  • 寫入過程被其餘事務阻塞。

首先對於第一種可能: 查看系統配置 dirty_ratio 的大小: 20。此值是 page cache 佔用系統可用內存(real mem + swap)的最大百分比, 咱們的內存爲 32G,沒有啓用 swap,則實際可用的 page cache 大小約爲 6G。

另外,與 pdflush 相關的系統配置:系統會每 vm.dirty_writeback_centisecs (5s) 喚醒一次 pdflush 線程, 發現髒頁比例超過 vm.dirty_background_ratio (10%) 或 髒頁存活時間超過 vm.dirty_expire_centisecs(30s) 時,會將髒頁刷回硬盤。

查看 /proc/meminfo 內 Dirty/Writeback 項的變化,並對比服務的文件寫入速度,結論是數據會被 pdflush 刷回到硬盤,不會觸發被動 flush 以阻塞 write 系統調用。

ext4 的 journal 特性


write 被阻塞的緣由

繼續搜索資料,在一篇文章(Why buffered writes are sometimes stalled )中看到 write 系統調用被阻塞有如下可能:

  • 要寫入的數據依賴讀取的結果時。但記錄日誌不依賴讀文件;
  • wirte page 時有別的線程在調用 fsync() 等主動 flush 髒頁的方法。但因爲鎖的存在,log 在寫入時不會有其餘的線程操做;
  • 格式爲 ext3/4 的文件系統在記錄 journal log 時會阻塞 write。而咱們的系統文件格式爲 ext4。維基百科上的一個條目( https://en.wikipedia.org/wiki/Journaling_block_device ) 也描述了這種可能。

journal

journal 是 文件系統保證數據一致性的一種手段,在寫入數據前,將即將進行的各個操做步驟記錄下來,一旦系統掉電,恢復時讀取這些日誌繼續操做就能夠了。但批量的 journal commit 是一個事務,flush 時會阻塞 write 的提交。

咱們可使用 dumpe2fs /dev/disk | grep features 查看磁盤支持的特性,其中有 has_journal 表明文件系統支持 journal 特性。

ext4 格式的文件系統在掛載時能夠選擇 (jouranling、ordered、writeback) 三種之一的 journal 記錄模式。

三種模式分別有如下特性:

  • journal: 在將數據寫入文件系統前,必須等待 metadata 和 journal 已經落盤了。
  • ordered: 不記錄數據的 journal,只記錄 metadata 的 journal 日誌,且須要保證全部數據在其 metadata journal 被 commit 以前落盤。 ext4 在不添加掛載參數時使用此模式。
  • writeback: 數據可能在 metadata journal 被提交以後落盤,可能致使舊數據在系統掉電後恢復到磁盤中。

固然,咱們也能夠選擇直接禁用 journal,使用 tune2fs -O ^has_journal /dev/disk,只能操做未被掛載的磁盤。

猜想由於 journal 觸發了髒頁落盤,而髒頁落盤致使 write 被阻塞,因此解決 journal 問題就能夠解決接口超時問題。

解決方案與壓測結果


如下是我總結的幾個接口超時問題的解決方案:

  1. log4j2 日誌模式改異步。但有可能會在系統重啓時丟失日誌,另外在異步隊列 ringbuffer 被填滿未消費後,新日誌會自動使用同步模式。
  2. 調整系統刷髒頁的配置,將檢查髒頁和髒頁過時時間設置得更短(1s 之內)。但理論上會略微提高系統負載(未明顯觀察到)。
  3. 掛載硬盤時使用 data=writeback 選項修改 journal 模式。 但可能致使系統重啓後文件包含已刪除的內容。
  4. 禁用 ext4 的 journal 特性。但可能會致使系統文件的不一致。
  5. 把 ext4 的 journal 日誌遷移到更快的磁盤上,如 ssd、閃存等。操做複雜,不易維護。
  6. 使用 xfs、fat 等 文件系統格式。特性不瞭解,影響不可知。

固然,對於這幾種方案,我也作了壓測,如下是壓測的結果。

 

  文件系統特性 接口超時比例
  ext4(同線上) 0.202%
  xfs文件系統 0.06%
  page過時時間和pdflush啓動時間都設置爲 0.8s 0.017%
  ext4 掛載時 journal 模式爲 writeback 0%
  禁用 ext4 的 journal 特性 0%
  log4j2 使用異步日誌 0%

小結


接口超時問題總算是告一段落,查了好久,不過解決它以後也很是有成就感。遺憾的是沒有在 linux 內核代碼中找到證據,160M 的代碼,分層也不熟悉,實在是無從查起,但願之後有機會能慢慢接觸吧。

程序員仍是要懂些操做系統知識的,不只幫咱們在應對這種詭異的問題時不至於一籌莫展,也能夠在作一些業務設計時能有所參考。

又熟悉了一些系統工具和命令,腳手架上又豐富了。

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